Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG3

Tmub1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub1Q9JMG3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmub1Q9JMG3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmub1Q9JMG3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmub1Q9JMG3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmub1Q9JMG3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmub1Q9JMG3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmub1Q9JMG3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmub1Q9JMG3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmub1Q9JMG3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmub1Q9JMG3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmub1Q9JMG3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmub1Q9JMG3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmub1Q9JMG3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmub1Q9JMG3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmub1Q9JMG3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmub1Q9JMG3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmub1Q9JMG3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmub1Q9JMG3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmub1Q9JMG3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmub1Q9JMG3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmub1Q9JMG3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmub1Q9JMG3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmub1Q9JMG3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmub1Q9JMG3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmub1Q9JMG3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmub1Q9JMG3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmub1Q9JMG3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmub1Q9JMG3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmub1Q9JMG3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmub1Q9JMG3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmub1Q9JMG3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmub1Q9JMG3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmub1Q9JMG3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmub1Q9JMG3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmub1Q9JMG3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmub1Q9JMG3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmub1Q9JMG3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmub1Q9JMG3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmub1Q9JMG3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmub1Q9JMG3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmub1Q9JMG3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmub1Q9JMG3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmub1Q9JMG3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmub1Q9JMG3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmub1Q9JMG3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmub1Q9JMG3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmub1Q9JMG3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmub1Q9JMG3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmub1Q9JMG3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmub1Q9JMG3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmub1Q9JMG3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmub1Q9JMG3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmub1Q9JMG3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmub1Q9JMG3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmub1Q9JMG3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmub1Q9JMG3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmub1Q9JMG3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmub1Q9JMG3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmub1Q9JMG3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmub1Q9JMG3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmub1Q9JMG3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmub1Q9JMG3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmub1Q9JMG3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmub1Q9JMG3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmub1Q9JMG3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmub1Q9JMG3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmub1Q9JMG3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmub1Q9JMG3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmub1Q9JMG3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmub1Q9JMG3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmub1Q9JMG3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmub1Q9JMG3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmub1Q9JMG3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmub1Q9JMG3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmub1Q9JMG3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmub1Q9JMG3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmub1Q9JMG3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmub1Q9JMG3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmub1Q9JMG3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmub1Q9JMG3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmub1Q9JMG3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmub1Q9JMG3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmub1Q9JMG3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmub1Q9JMG3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmub1Q9JMG3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmub1Q9JMG3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmub1Q9JMG3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmub1Q9JMG3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmub1Q9JMG3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmub1Q9JMG3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmub1Q9JMG3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmub1Q9JMG3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmub1Q9JMG3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmub1Q9JMG3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmub1Q9JMG3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmub1Q9JMG3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmub1Q9JMG3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmub1Q9JMG3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmub1Q9JMG3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmub1Q9JMG3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms