Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Cabp1Q9JLK7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Cabp1Q9JLK7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Cabp1Q9JLK7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Cabp1Q9JLK7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Cabp1Q9JLK7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Cabp1Q9JLK7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Cabp1Q9JLK7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Cabp1Q9JLK7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Cabp1Q9JLK7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Cabp1Q9JLK7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Cabp1Q9JLK7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Cabp1Q9JLK7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Cabp1Q9JLK7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Cabp1Q9JLK7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Cabp1Q9JLK7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Cabp1Q9JLK7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Cabp1Q9JLK7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Cabp1Q9JLK7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cabp1Q9JLK7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Cabp1Q9JLK7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Cabp1Q9JLK7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Cabp1Q9JLK7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Cabp1Q9JLK7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Cabp1Q9JLK7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Cabp1Q9JLK7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Cabp1Q9JLK7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Cabp1Q9JLK7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Cabp1Q9JLK7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Cabp1Q9JLK7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Cabp1Q9JLK7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Cabp1Q9JLK7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cabp1Q9JLK7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Cabp1Q9JLK7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Cabp1Q9JLK7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
Cabp1Q9JLK7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Cabp1Q9JLK7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Cabp1Q9JLK7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cabp1Q9JLK7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cabp1Q9JLK7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Cabp1Q9JLK7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Cabp1Q9JLK7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Cabp1Q9JLK7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Cabp1Q9JLK7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Cabp1Q9JLK7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Cabp1Q9JLK7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cabp1Q9JLK7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Cabp1Q9JLK7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cabp1Q9JLK7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Cabp1Q9JLK7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Cabp1Q9JLK7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Cabp1Q9JLK7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Cabp1Q9JLK7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Cabp1Q9JLK7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Cabp1Q9JLK7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Cabp1Q9JLK7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Cabp1Q9JLK7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Cabp1Q9JLK7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Cabp1Q9JLK7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Cabp1Q9JLK7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Cabp1Q9JLK7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Cabp1Q9JLK7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Cabp1Q9JLK7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Cabp1Q9JLK7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Cabp1Q9JLK7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Cabp1Q9JLK7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Cabp1Q9JLK7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Cabp1Q9JLK7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Cabp1Q9JLK7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Cabp1Q9JLK7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Cabp1Q9JLK7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Cabp1Q9JLK7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Cabp1Q9JLK7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Cabp1Q9JLK7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Cabp1Q9JLK7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Cabp1Q9JLK7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Cabp1Q9JLK7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Cabp1Q9JLK7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Cabp1Q9JLK7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cabp1Q9JLK7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Cabp1Q9JLK7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Cabp1Q9JLK7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Cabp1Q9JLK7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Cabp1Q9JLK7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Cabp1Q9JLK7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Cabp1Q9JLK7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Cabp1Q9JLK7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Cabp1Q9JLK7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Cabp1Q9JLK7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Cabp1Q9JLK7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Cabp1Q9JLK7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Cabp1Q9JLK7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cabp1Q9JLK7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cabp1Q9JLK7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Cabp1Q9JLK7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Cabp1Q9JLK7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Cabp1Q9JLK7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Cabp1Q9JLK7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Cabp1Q9JLK7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Cabp1Q9JLK7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms