Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SacsQ9JLC8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SacsQ9JLC8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SacsQ9JLC8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SacsQ9JLC8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SacsQ9JLC8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SacsQ9JLC8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SacsQ9JLC8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SacsQ9JLC8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SacsQ9JLC8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SacsQ9JLC8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SacsQ9JLC8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SacsQ9JLC8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SacsQ9JLC8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SacsQ9JLC8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SacsQ9JLC8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SacsQ9JLC8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SacsQ9JLC8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SacsQ9JLC8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SacsQ9JLC8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SacsQ9JLC8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SacsQ9JLC8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SacsQ9JLC8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SacsQ9JLC8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SacsQ9JLC8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SacsQ9JLC8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SacsQ9JLC8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SacsQ9JLC8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SacsQ9JLC8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SacsQ9JLC8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SacsQ9JLC8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SacsQ9JLC8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SacsQ9JLC8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SacsQ9JLC8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SacsQ9JLC8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SacsQ9JLC8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SacsQ9JLC8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SacsQ9JLC8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SacsQ9JLC8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SacsQ9JLC8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SacsQ9JLC8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SacsQ9JLC8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SacsQ9JLC8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SacsQ9JLC8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SacsQ9JLC8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SacsQ9JLC8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SacsQ9JLC8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SacsQ9JLC8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SacsQ9JLC8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SacsQ9JLC8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SacsQ9JLC8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SacsQ9JLC8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SacsQ9JLC8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SacsQ9JLC8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SacsQ9JLC8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SacsQ9JLC8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SacsQ9JLC8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SacsQ9JLC8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SacsQ9JLC8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SacsQ9JLC8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SacsQ9JLC8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SacsQ9JLC8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SacsQ9JLC8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SacsQ9JLC8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SacsQ9JLC8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SacsQ9JLC8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SacsQ9JLC8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SacsQ9JLC8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SacsQ9JLC8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SacsQ9JLC8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SacsQ9JLC8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SacsQ9JLC8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SacsQ9JLC8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SacsQ9JLC8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SacsQ9JLC8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SacsQ9JLC8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SacsQ9JLC8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SacsQ9JLC8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SacsQ9JLC8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SacsQ9JLC8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SacsQ9JLC8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SacsQ9JLC8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SacsQ9JLC8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SacsQ9JLC8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SacsQ9JLC8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SacsQ9JLC8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SacsQ9JLC8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SacsQ9JLC8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SacsQ9JLC8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SacsQ9JLC8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SacsQ9JLC8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SacsQ9JLC8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SacsQ9JLC8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SacsQ9JLC8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SacsQ9JLC8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SacsQ9JLC8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SacsQ9JLC8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SacsQ9JLC8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SacsQ9JLC8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SacsQ9JLC8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms