Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL89

Ninj2, Ninjurin-2, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ninj2Q9JL89 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ninj2Q9JL89 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ninj2Q9JL89 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ninj2Q9JL89 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ninj2Q9JL89 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ninj2Q9JL89 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ninj2Q9JL89 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ninj2Q9JL89 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ninj2Q9JL89 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ninj2Q9JL89 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ninj2Q9JL89 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ninj2Q9JL89 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ninj2Q9JL89 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ninj2Q9JL89 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ninj2Q9JL89 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ninj2Q9JL89 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ninj2Q9JL89 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ninj2Q9JL89 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ninj2Q9JL89 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ninj2Q9JL89 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ninj2Q9JL89 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ninj2Q9JL89 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ninj2Q9JL89 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ninj2Q9JL89 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ninj2Q9JL89 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ninj2Q9JL89 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ninj2Q9JL89 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ninj2Q9JL89 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ninj2Q9JL89 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ninj2Q9JL89 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ninj2Q9JL89 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ninj2Q9JL89 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ninj2Q9JL89 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ninj2Q9JL89 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ninj2Q9JL89 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ninj2Q9JL89 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ninj2Q9JL89 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ninj2Q9JL89 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ninj2Q9JL89 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ninj2Q9JL89 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ninj2Q9JL89 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ninj2Q9JL89 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ninj2Q9JL89 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ninj2Q9JL89 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ninj2Q9JL89 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ninj2Q9JL89 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ninj2Q9JL89 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ninj2Q9JL89 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ninj2Q9JL89 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ninj2Q9JL89 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ninj2Q9JL89 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ninj2Q9JL89 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ninj2Q9JL89 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ninj2Q9JL89 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ninj2Q9JL89 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ninj2Q9JL89 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ninj2Q9JL89 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ninj2Q9JL89 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ninj2Q9JL89 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ninj2Q9JL89 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ninj2Q9JL89 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ninj2Q9JL89 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ninj2Q9JL89 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ninj2Q9JL89 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ninj2Q9JL89 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ninj2Q9JL89 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ninj2Q9JL89 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ninj2Q9JL89 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ninj2Q9JL89 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ninj2Q9JL89 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ninj2Q9JL89 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ninj2Q9JL89 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ninj2Q9JL89 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ninj2Q9JL89 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ninj2Q9JL89 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ninj2Q9JL89 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ninj2Q9JL89 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ninj2Q9JL89 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ninj2Q9JL89 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ninj2Q9JL89 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ninj2Q9JL89 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ninj2Q9JL89 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ninj2Q9JL89 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ninj2Q9JL89 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ninj2Q9JL89 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ninj2Q9JL89 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ninj2Q9JL89 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ninj2Q9JL89 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ninj2Q9JL89 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ninj2Q9JL89 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ninj2Q9JL89 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ninj2Q9JL89 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ninj2Q9JL89 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ninj2Q9JL89 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ninj2Q9JL89 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ninj2Q9JL89 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ninj2Q9JL89 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ninj2Q9JL89 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ninj2Q9JL89 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ninj2Q9JL89 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms