Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ldb3Q9JKS4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ldb3Q9JKS4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ldb3Q9JKS4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ldb3Q9JKS4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ldb3Q9JKS4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ldb3Q9JKS4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ldb3Q9JKS4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ldb3Q9JKS4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ldb3Q9JKS4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ldb3Q9JKS4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ldb3Q9JKS4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ldb3Q9JKS4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ldb3Q9JKS4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ldb3Q9JKS4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ldb3Q9JKS4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ldb3Q9JKS4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ldb3Q9JKS4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ldb3Q9JKS4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ldb3Q9JKS4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ldb3Q9JKS4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ldb3Q9JKS4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ldb3Q9JKS4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ldb3Q9JKS4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ldb3Q9JKS4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ldb3Q9JKS4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ldb3Q9JKS4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ldb3Q9JKS4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ldb3Q9JKS4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ldb3Q9JKS4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ldb3Q9JKS4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ldb3Q9JKS4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ldb3Q9JKS4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ldb3Q9JKS4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ldb3Q9JKS4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ldb3Q9JKS4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ldb3Q9JKS4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ldb3Q9JKS4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ldb3Q9JKS4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ldb3Q9JKS4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ldb3Q9JKS4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ldb3Q9JKS4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ldb3Q9JKS4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ldb3Q9JKS4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ldb3Q9JKS4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ldb3Q9JKS4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ldb3Q9JKS4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ldb3Q9JKS4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ldb3Q9JKS4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ldb3Q9JKS4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ldb3Q9JKS4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ldb3Q9JKS4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ldb3Q9JKS4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ldb3Q9JKS4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ldb3Q9JKS4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ldb3Q9JKS4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ldb3Q9JKS4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ldb3Q9JKS4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ldb3Q9JKS4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ldb3Q9JKS4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ldb3Q9JKS4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ldb3Q9JKS4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ldb3Q9JKS4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ldb3Q9JKS4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ldb3Q9JKS4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ldb3Q9JKS4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ldb3Q9JKS4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ldb3Q9JKS4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ldb3Q9JKS4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ldb3Q9JKS4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ldb3Q9JKS4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ldb3Q9JKS4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ldb3Q9JKS4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ldb3Q9JKS4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ldb3Q9JKS4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ldb3Q9JKS4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ldb3Q9JKS4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ldb3Q9JKS4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ldb3Q9JKS4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ldb3Q9JKS4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ldb3Q9JKS4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ldb3Q9JKS4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ldb3Q9JKS4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ldb3Q9JKS4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ldb3Q9JKS4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ldb3Q9JKS4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ldb3Q9JKS4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ldb3Q9JKS4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ldb3Q9JKS4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ldb3Q9JKS4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ldb3Q9JKS4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ldb3Q9JKS4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ldb3Q9JKS4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ldb3Q9JKS4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ldb3Q9JKS4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ldb3Q9JKS4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ldb3Q9JKS4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ldb3Q9JKS4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ldb3Q9JKS4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms