Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ddx20Q9JJY4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ddx20Q9JJY4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ddx20Q9JJY4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ddx20Q9JJY4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ddx20Q9JJY4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ddx20Q9JJY4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ddx20Q9JJY4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ddx20Q9JJY4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ddx20Q9JJY4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Ddx20Q9JJY4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ddx20Q9JJY4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ddx20Q9JJY4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ddx20Q9JJY4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ddx20Q9JJY4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ddx20Q9JJY4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ddx20Q9JJY4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ddx20Q9JJY4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ddx20Q9JJY4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ddx20Q9JJY4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ddx20Q9JJY4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ddx20Q9JJY4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ddx20Q9JJY4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ddx20Q9JJY4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ddx20Q9JJY4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ddx20Q9JJY4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ddx20Q9JJY4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ddx20Q9JJY4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ddx20Q9JJY4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ddx20Q9JJY4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ddx20Q9JJY4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ddx20Q9JJY4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ddx20Q9JJY4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ddx20Q9JJY4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ddx20Q9JJY4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ddx20Q9JJY4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ddx20Q9JJY4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Ddx20Q9JJY4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ddx20Q9JJY4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ddx20Q9JJY4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ddx20Q9JJY4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ddx20Q9JJY4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ddx20Q9JJY4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ddx20Q9JJY4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ddx20Q9JJY4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ddx20Q9JJY4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ddx20Q9JJY4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ddx20Q9JJY4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Ddx20Q9JJY4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ddx20Q9JJY4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ddx20Q9JJY4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ddx20Q9JJY4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ddx20Q9JJY4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ddx20Q9JJY4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ddx20Q9JJY4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ddx20Q9JJY4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ddx20Q9JJY4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ddx20Q9JJY4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Ddx20Q9JJY4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ddx20Q9JJY4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ddx20Q9JJY4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ddx20Q9JJY4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ddx20Q9JJY4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ddx20Q9JJY4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ddx20Q9JJY4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ddx20Q9JJY4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ddx20Q9JJY4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ddx20Q9JJY4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ddx20Q9JJY4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ddx20Q9JJY4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ddx20Q9JJY4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ddx20Q9JJY4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ddx20Q9JJY4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Ddx20Q9JJY4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ddx20Q9JJY4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ddx20Q9JJY4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ddx20Q9JJY4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ddx20Q9JJY4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ddx20Q9JJY4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ddx20Q9JJY4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ddx20Q9JJY4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ddx20Q9JJY4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ddx20Q9JJY4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ddx20Q9JJY4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ddx20Q9JJY4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ddx20Q9JJY4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ddx20Q9JJY4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ddx20Q9JJY4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ddx20Q9JJY4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ddx20Q9JJY4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ddx20Q9JJY4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ddx20Q9JJY4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ddx20Q9JJY4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ddx20Q9JJY4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ddx20Q9JJY4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ddx20Q9JJY4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ddx20Q9JJY4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ddx20Q9JJY4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ddx20Q9JJY4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ddx20Q9JJY4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
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