Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI91

Actn2, Alpha-actinin-2, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn2Q9JI91 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Actn2Q9JI91 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Actn2Q9JI91 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Actn2Q9JI91 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Actn2Q9JI91 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Actn2Q9JI91 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Actn2Q9JI91 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Actn2Q9JI91 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Actn2Q9JI91 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Actn2Q9JI91 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Actn2Q9JI91 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Actn2Q9JI91 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Actn2Q9JI91 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Actn2Q9JI91 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Actn2Q9JI91 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Actn2Q9JI91 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Actn2Q9JI91 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Actn2Q9JI91 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Actn2Q9JI91 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Actn2Q9JI91 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Actn2Q9JI91 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Actn2Q9JI91 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Actn2Q9JI91 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Actn2Q9JI91 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Actn2Q9JI91 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Actn2Q9JI91 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Actn2Q9JI91 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Actn2Q9JI91 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Actn2Q9JI91 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Actn2Q9JI91 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Actn2Q9JI91 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Actn2Q9JI91 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Actn2Q9JI91 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Actn2Q9JI91 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Actn2Q9JI91 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Actn2Q9JI91 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Actn2Q9JI91 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Actn2Q9JI91 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Actn2Q9JI91 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Actn2Q9JI91 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Actn2Q9JI91 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Actn2Q9JI91 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Actn2Q9JI91 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Actn2Q9JI91 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Actn2Q9JI91 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Actn2Q9JI91 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Actn2Q9JI91 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Actn2Q9JI91 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Actn2Q9JI91 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Actn2Q9JI91 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Actn2Q9JI91 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Actn2Q9JI91 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Actn2Q9JI91 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Actn2Q9JI91 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Actn2Q9JI91 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Actn2Q9JI91 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Actn2Q9JI91 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Actn2Q9JI91 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Actn2Q9JI91 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Actn2Q9JI91 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Actn2Q9JI91 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Actn2Q9JI91 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Actn2Q9JI91 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Actn2Q9JI91 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Actn2Q9JI91 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Actn2Q9JI91 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Actn2Q9JI91 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Actn2Q9JI91 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Actn2Q9JI91 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Actn2Q9JI91 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Actn2Q9JI91 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Actn2Q9JI91 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Actn2Q9JI91 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Actn2Q9JI91 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Actn2Q9JI91 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Actn2Q9JI91 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Actn2Q9JI91 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Actn2Q9JI91 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Actn2Q9JI91 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Actn2Q9JI91 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Actn2Q9JI91 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Actn2Q9JI91 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Actn2Q9JI91 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Actn2Q9JI91 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Actn2Q9JI91 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Actn2Q9JI91 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Actn2Q9JI91 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Actn2Q9JI91 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Actn2Q9JI91 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Actn2Q9JI91 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Actn2Q9JI91 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Actn2Q9JI91 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Actn2Q9JI91 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Actn2Q9JI91 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Actn2Q9JI91 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Actn2Q9JI91 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Actn2Q9JI91 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Actn2Q9JI91 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Actn2Q9JI91 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Actn2Q9JI91 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms