Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI4

Slc13a1, Solute carrier family 13 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc13a1Q9JHI4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc13a1Q9JHI4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc13a1Q9JHI4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc13a1Q9JHI4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc13a1Q9JHI4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc13a1Q9JHI4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc13a1Q9JHI4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc13a1Q9JHI4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc13a1Q9JHI4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc13a1Q9JHI4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc13a1Q9JHI4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc13a1Q9JHI4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc13a1Q9JHI4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc13a1Q9JHI4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc13a1Q9JHI4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc13a1Q9JHI4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc13a1Q9JHI4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc13a1Q9JHI4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc13a1Q9JHI4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc13a1Q9JHI4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc13a1Q9JHI4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc13a1Q9JHI4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc13a1Q9JHI4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc13a1Q9JHI4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc13a1Q9JHI4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc13a1Q9JHI4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc13a1Q9JHI4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc13a1Q9JHI4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc13a1Q9JHI4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc13a1Q9JHI4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc13a1Q9JHI4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc13a1Q9JHI4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc13a1Q9JHI4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc13a1Q9JHI4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc13a1Q9JHI4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc13a1Q9JHI4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc13a1Q9JHI4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc13a1Q9JHI4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc13a1Q9JHI4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc13a1Q9JHI4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc13a1Q9JHI4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc13a1Q9JHI4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc13a1Q9JHI4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc13a1Q9JHI4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc13a1Q9JHI4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc13a1Q9JHI4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc13a1Q9JHI4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Slc13a1Q9JHI4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc13a1Q9JHI4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc13a1Q9JHI4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc13a1Q9JHI4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc13a1Q9JHI4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc13a1Q9JHI4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc13a1Q9JHI4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc13a1Q9JHI4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc13a1Q9JHI4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc13a1Q9JHI4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc13a1Q9JHI4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc13a1Q9JHI4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc13a1Q9JHI4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc13a1Q9JHI4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc13a1Q9JHI4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc13a1Q9JHI4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc13a1Q9JHI4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc13a1Q9JHI4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc13a1Q9JHI4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc13a1Q9JHI4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc13a1Q9JHI4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc13a1Q9JHI4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc13a1Q9JHI4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc13a1Q9JHI4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc13a1Q9JHI4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc13a1Q9JHI4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc13a1Q9JHI4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc13a1Q9JHI4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc13a1Q9JHI4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc13a1Q9JHI4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc13a1Q9JHI4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc13a1Q9JHI4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc13a1Q9JHI4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc13a1Q9JHI4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc13a1Q9JHI4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc13a1Q9JHI4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc13a1Q9JHI4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc13a1Q9JHI4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc13a1Q9JHI4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc13a1Q9JHI4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc13a1Q9JHI4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc13a1Q9JHI4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc13a1Q9JHI4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc13a1Q9JHI4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc13a1Q9JHI4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc13a1Q9JHI4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc13a1Q9JHI4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc13a1Q9JHI4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc13a1Q9JHI4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc13a1Q9JHI4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc13a1Q9JHI4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc13a1Q9JHI4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc13a1Q9JHI4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms