Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubb3Q9ERD7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubb3Q9ERD7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubb3Q9ERD7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tubb3Q9ERD7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tubb3Q9ERD7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubb3Q9ERD7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubb3Q9ERD7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubb3Q9ERD7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubb3Q9ERD7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubb3Q9ERD7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubb3Q9ERD7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubb3Q9ERD7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubb3Q9ERD7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubb3Q9ERD7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubb3Q9ERD7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubb3Q9ERD7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubb3Q9ERD7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubb3Q9ERD7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubb3Q9ERD7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubb3Q9ERD7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubb3Q9ERD7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubb3Q9ERD7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubb3Q9ERD7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubb3Q9ERD7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tubb3Q9ERD7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tubb3Q9ERD7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tubb3Q9ERD7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tubb3Q9ERD7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tubb3Q9ERD7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tubb3Q9ERD7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tubb3Q9ERD7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tubb3Q9ERD7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tubb3Q9ERD7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tubb3Q9ERD7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubb3Q9ERD7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubb3Q9ERD7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubb3Q9ERD7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Tubb3Q9ERD7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tubb3Q9ERD7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tubb3Q9ERD7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tubb3Q9ERD7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubb3Q9ERD7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubb3Q9ERD7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubb3Q9ERD7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubb3Q9ERD7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubb3Q9ERD7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubb3Q9ERD7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubb3Q9ERD7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubb3Q9ERD7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubb3Q9ERD7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubb3Q9ERD7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubb3Q9ERD7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubb3Q9ERD7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubb3Q9ERD7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tubb3Q9ERD7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubb3Q9ERD7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubb3Q9ERD7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubb3Q9ERD7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubb3Q9ERD7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubb3Q9ERD7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubb3Q9ERD7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubb3Q9ERD7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubb3Q9ERD7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubb3Q9ERD7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubb3Q9ERD7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubb3Q9ERD7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubb3Q9ERD7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubb3Q9ERD7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubb3Q9ERD7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubb3Q9ERD7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubb3Q9ERD7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubb3Q9ERD7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubb3Q9ERD7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubb3Q9ERD7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubb3Q9ERD7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubb3Q9ERD7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubb3Q9ERD7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubb3Q9ERD7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubb3Q9ERD7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubb3Q9ERD7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubb3Q9ERD7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubb3Q9ERD7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubb3Q9ERD7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubb3Q9ERD7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubb3Q9ERD7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubb3Q9ERD7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubb3Q9ERD7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubb3Q9ERD7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubb3Q9ERD7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubb3Q9ERD7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubb3Q9ERD7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubb3Q9ERD7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubb3Q9ERD7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubb3Q9ERD7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubb3Q9ERD7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubb3Q9ERD7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubb3Q9ERD7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubb3Q9ERD7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubb3Q9ERD7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms