Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ7

Rims2, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims2Q9EQZ7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rims2Q9EQZ7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rims2Q9EQZ7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rims2Q9EQZ7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rims2Q9EQZ7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rims2Q9EQZ7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rims2Q9EQZ7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rims2Q9EQZ7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Rims2Q9EQZ7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rims2Q9EQZ7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rims2Q9EQZ7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Rims2Q9EQZ7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Rims2Q9EQZ7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Rims2Q9EQZ7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Rims2Q9EQZ7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rims2Q9EQZ7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rims2Q9EQZ7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rims2Q9EQZ7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Rims2Q9EQZ7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Rims2Q9EQZ7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Rims2Q9EQZ7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Rims2Q9EQZ7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Rims2Q9EQZ7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Rims2Q9EQZ7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Rims2Q9EQZ7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Rims2Q9EQZ7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Rims2Q9EQZ7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Rims2Q9EQZ7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rims2Q9EQZ7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rims2Q9EQZ7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rims2Q9EQZ7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Rims2Q9EQZ7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Rims2Q9EQZ7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rims2Q9EQZ7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rims2Q9EQZ7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Rims2Q9EQZ7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rims2Q9EQZ7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rims2Q9EQZ7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rims2Q9EQZ7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rims2Q9EQZ7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Rims2Q9EQZ7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rims2Q9EQZ7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rims2Q9EQZ7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rims2Q9EQZ7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rims2Q9EQZ7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rims2Q9EQZ7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rims2Q9EQZ7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Rims2Q9EQZ7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rims2Q9EQZ7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rims2Q9EQZ7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rims2Q9EQZ7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Rims2Q9EQZ7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Rims2Q9EQZ7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Rims2Q9EQZ7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rims2Q9EQZ7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rims2Q9EQZ7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rims2Q9EQZ7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rims2Q9EQZ7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Rims2Q9EQZ7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rims2Q9EQZ7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rims2Q9EQZ7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rims2Q9EQZ7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Rims2Q9EQZ7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rims2Q9EQZ7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rims2Q9EQZ7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rims2Q9EQZ7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rims2Q9EQZ7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rims2Q9EQZ7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Rims2Q9EQZ7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Rims2Q9EQZ7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rims2Q9EQZ7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Rims2Q9EQZ7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rims2Q9EQZ7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rims2Q9EQZ7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rims2Q9EQZ7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rims2Q9EQZ7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rims2Q9EQZ7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Rims2Q9EQZ7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Rims2Q9EQZ7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Rims2Q9EQZ7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rims2Q9EQZ7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rims2Q9EQZ7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rims2Q9EQZ7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rims2Q9EQZ7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rims2Q9EQZ7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rims2Q9EQZ7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rims2Q9EQZ7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Rims2Q9EQZ7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rims2Q9EQZ7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Rims2Q9EQZ7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rims2Q9EQZ7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rims2Q9EQZ7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rims2Q9EQZ7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rims2Q9EQZ7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rims2Q9EQZ7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rims2Q9EQZ7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rims2Q9EQZ7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Rims2Q9EQZ7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rims2Q9EQZ7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rims2Q9EQZ7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms