Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQQ2

Yipf5, Protein YIPF5, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf5Q9EQQ2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Yipf5Q9EQQ2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Yipf5Q9EQQ2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Yipf5Q9EQQ2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Yipf5Q9EQQ2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Yipf5Q9EQQ2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Yipf5Q9EQQ2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Yipf5Q9EQQ2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Yipf5Q9EQQ2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Yipf5Q9EQQ2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Yipf5Q9EQQ2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Yipf5Q9EQQ2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Yipf5Q9EQQ2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Yipf5Q9EQQ2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Yipf5Q9EQQ2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Yipf5Q9EQQ2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Yipf5Q9EQQ2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Yipf5Q9EQQ2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Yipf5Q9EQQ2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Yipf5Q9EQQ2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Yipf5Q9EQQ2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Yipf5Q9EQQ2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Yipf5Q9EQQ2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Yipf5Q9EQQ2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Yipf5Q9EQQ2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Yipf5Q9EQQ2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Yipf5Q9EQQ2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Yipf5Q9EQQ2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Yipf5Q9EQQ2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Yipf5Q9EQQ2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Yipf5Q9EQQ2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Yipf5Q9EQQ2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Yipf5Q9EQQ2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Yipf5Q9EQQ2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Yipf5Q9EQQ2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Yipf5Q9EQQ2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Yipf5Q9EQQ2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Yipf5Q9EQQ2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Yipf5Q9EQQ2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Yipf5Q9EQQ2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Yipf5Q9EQQ2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Yipf5Q9EQQ2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Yipf5Q9EQQ2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Yipf5Q9EQQ2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Yipf5Q9EQQ2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Yipf5Q9EQQ2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Yipf5Q9EQQ2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Yipf5Q9EQQ2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Yipf5Q9EQQ2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Yipf5Q9EQQ2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Yipf5Q9EQQ2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Yipf5Q9EQQ2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Yipf5Q9EQQ2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Yipf5Q9EQQ2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Yipf5Q9EQQ2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Yipf5Q9EQQ2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Yipf5Q9EQQ2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Yipf5Q9EQQ2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Yipf5Q9EQQ2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Yipf5Q9EQQ2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Yipf5Q9EQQ2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yipf5Q9EQQ2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yipf5Q9EQQ2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yipf5Q9EQQ2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yipf5Q9EQQ2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Yipf5Q9EQQ2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Yipf5Q9EQQ2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Yipf5Q9EQQ2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Yipf5Q9EQQ2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Yipf5Q9EQQ2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Yipf5Q9EQQ2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Yipf5Q9EQQ2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Yipf5Q9EQQ2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Yipf5Q9EQQ2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Yipf5Q9EQQ2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Yipf5Q9EQQ2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Yipf5Q9EQQ2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Yipf5Q9EQQ2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Yipf5Q9EQQ2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Yipf5Q9EQQ2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Yipf5Q9EQQ2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Yipf5Q9EQQ2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Yipf5Q9EQQ2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Yipf5Q9EQQ2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Yipf5Q9EQQ2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Yipf5Q9EQQ2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Yipf5Q9EQQ2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Yipf5Q9EQQ2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yipf5Q9EQQ2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yipf5Q9EQQ2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yipf5Q9EQQ2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yipf5Q9EQQ2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yipf5Q9EQQ2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Yipf5Q9EQQ2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Yipf5Q9EQQ2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Yipf5Q9EQQ2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Yipf5Q9EQQ2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Yipf5Q9EQQ2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Yipf5Q9EQQ2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Yipf5Q9EQQ2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms