Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQI5

Ppbp, Chemokine (C-X-C motif) ligand 7, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpbpQ9EQI5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpbpQ9EQI5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpbpQ9EQI5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpbpQ9EQI5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpbpQ9EQI5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpbpQ9EQI5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpbpQ9EQI5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpbpQ9EQI5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpbpQ9EQI5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpbpQ9EQI5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpbpQ9EQI5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpbpQ9EQI5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpbpQ9EQI5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpbpQ9EQI5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpbpQ9EQI5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpbpQ9EQI5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpbpQ9EQI5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpbpQ9EQI5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpbpQ9EQI5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpbpQ9EQI5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpbpQ9EQI5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpbpQ9EQI5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpbpQ9EQI5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpbpQ9EQI5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpbpQ9EQI5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpbpQ9EQI5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpbpQ9EQI5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpbpQ9EQI5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpbpQ9EQI5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpbpQ9EQI5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpbpQ9EQI5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpbpQ9EQI5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpbpQ9EQI5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpbpQ9EQI5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpbpQ9EQI5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpbpQ9EQI5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpbpQ9EQI5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpbpQ9EQI5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpbpQ9EQI5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PpbpQ9EQI5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpbpQ9EQI5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpbpQ9EQI5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpbpQ9EQI5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpbpQ9EQI5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpbpQ9EQI5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpbpQ9EQI5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PpbpQ9EQI5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpbpQ9EQI5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpbpQ9EQI5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpbpQ9EQI5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpbpQ9EQI5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpbpQ9EQI5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpbpQ9EQI5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpbpQ9EQI5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpbpQ9EQI5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpbpQ9EQI5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpbpQ9EQI5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpbpQ9EQI5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpbpQ9EQI5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpbpQ9EQI5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpbpQ9EQI5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpbpQ9EQI5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpbpQ9EQI5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpbpQ9EQI5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpbpQ9EQI5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpbpQ9EQI5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PpbpQ9EQI5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PpbpQ9EQI5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpbpQ9EQI5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpbpQ9EQI5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PpbpQ9EQI5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpbpQ9EQI5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpbpQ9EQI5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpbpQ9EQI5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpbpQ9EQI5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpbpQ9EQI5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpbpQ9EQI5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpbpQ9EQI5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpbpQ9EQI5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpbpQ9EQI5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpbpQ9EQI5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpbpQ9EQI5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpbpQ9EQI5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpbpQ9EQI5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpbpQ9EQI5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpbpQ9EQI5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpbpQ9EQI5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PpbpQ9EQI5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PpbpQ9EQI5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpbpQ9EQI5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpbpQ9EQI5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PpbpQ9EQI5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpbpQ9EQI5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PpbpQ9EQI5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpbpQ9EQI5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpbpQ9EQI5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpbpQ9EQI5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpbpQ9EQI5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PpbpQ9EQI5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PpbpQ9EQI5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms