Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col4a3bpQ9EQG9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col4a3bpQ9EQG9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col4a3bpQ9EQG9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col4a3bpQ9EQG9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col4a3bpQ9EQG9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col4a3bpQ9EQG9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col4a3bpQ9EQG9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col4a3bpQ9EQG9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col4a3bpQ9EQG9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col4a3bpQ9EQG9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Col4a3bpQ9EQG9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Col4a3bpQ9EQG9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Col4a3bpQ9EQG9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Col4a3bpQ9EQG9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col4a3bpQ9EQG9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col4a3bpQ9EQG9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col4a3bpQ9EQG9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col4a3bpQ9EQG9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col4a3bpQ9EQG9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col4a3bpQ9EQG9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col4a3bpQ9EQG9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col4a3bpQ9EQG9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col4a3bpQ9EQG9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col4a3bpQ9EQG9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col4a3bpQ9EQG9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Col4a3bpQ9EQG9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Col4a3bpQ9EQG9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Col4a3bpQ9EQG9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Col4a3bpQ9EQG9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Col4a3bpQ9EQG9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col4a3bpQ9EQG9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col4a3bpQ9EQG9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col4a3bpQ9EQG9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col4a3bpQ9EQG9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col4a3bpQ9EQG9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col4a3bpQ9EQG9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Col4a3bpQ9EQG9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col4a3bpQ9EQG9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col4a3bpQ9EQG9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col4a3bpQ9EQG9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col4a3bpQ9EQG9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col4a3bpQ9EQG9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col4a3bpQ9EQG9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col4a3bpQ9EQG9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col4a3bpQ9EQG9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col4a3bpQ9EQG9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col4a3bpQ9EQG9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col4a3bpQ9EQG9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col4a3bpQ9EQG9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col4a3bpQ9EQG9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col4a3bpQ9EQG9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col4a3bpQ9EQG9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col4a3bpQ9EQG9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col4a3bpQ9EQG9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col4a3bpQ9EQG9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col4a3bpQ9EQG9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col4a3bpQ9EQG9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col4a3bpQ9EQG9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col4a3bpQ9EQG9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col4a3bpQ9EQG9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col4a3bpQ9EQG9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col4a3bpQ9EQG9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col4a3bpQ9EQG9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col4a3bpQ9EQG9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col4a3bpQ9EQG9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col4a3bpQ9EQG9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col4a3bpQ9EQG9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col4a3bpQ9EQG9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col4a3bpQ9EQG9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col4a3bpQ9EQG9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Col4a3bpQ9EQG9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Col4a3bpQ9EQG9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Col4a3bpQ9EQG9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col4a3bpQ9EQG9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col4a3bpQ9EQG9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col4a3bpQ9EQG9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col4a3bpQ9EQG9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col4a3bpQ9EQG9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col4a3bpQ9EQG9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col4a3bpQ9EQG9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col4a3bpQ9EQG9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col4a3bpQ9EQG9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col4a3bpQ9EQG9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Col4a3bpQ9EQG9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col4a3bpQ9EQG9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col4a3bpQ9EQG9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col4a3bpQ9EQG9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col4a3bpQ9EQG9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col4a3bpQ9EQG9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Col4a3bpQ9EQG9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col4a3bpQ9EQG9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col4a3bpQ9EQG9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col4a3bpQ9EQG9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col4a3bpQ9EQG9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col4a3bpQ9EQG9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col4a3bpQ9EQG9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col4a3bpQ9EQG9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms