Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcr6Q9EQ16 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcr6Q9EQ16 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcr6Q9EQ16 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcr6Q9EQ16 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxcr6Q9EQ16 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxcr6Q9EQ16 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxcr6Q9EQ16 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxcr6Q9EQ16 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxcr6Q9EQ16 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxcr6Q9EQ16 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxcr6Q9EQ16 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxcr6Q9EQ16 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxcr6Q9EQ16 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxcr6Q9EQ16 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxcr6Q9EQ16 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxcr6Q9EQ16 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxcr6Q9EQ16 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxcr6Q9EQ16 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxcr6Q9EQ16 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxcr6Q9EQ16 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxcr6Q9EQ16 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxcr6Q9EQ16 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxcr6Q9EQ16 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxcr6Q9EQ16 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxcr6Q9EQ16 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxcr6Q9EQ16 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxcr6Q9EQ16 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxcr6Q9EQ16 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxcr6Q9EQ16 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxcr6Q9EQ16 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxcr6Q9EQ16 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxcr6Q9EQ16 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cxcr6Q9EQ16 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxcr6Q9EQ16 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxcr6Q9EQ16 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxcr6Q9EQ16 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxcr6Q9EQ16 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cxcr6Q9EQ16 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxcr6Q9EQ16 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxcr6Q9EQ16 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxcr6Q9EQ16 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcr6Q9EQ16 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcr6Q9EQ16 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcr6Q9EQ16 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcr6Q9EQ16 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcr6Q9EQ16 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcr6Q9EQ16 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcr6Q9EQ16 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcr6Q9EQ16 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcr6Q9EQ16 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcr6Q9EQ16 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcr6Q9EQ16 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxcr6Q9EQ16 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxcr6Q9EQ16 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxcr6Q9EQ16 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxcr6Q9EQ16 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxcr6Q9EQ16 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxcr6Q9EQ16 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxcr6Q9EQ16 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxcr6Q9EQ16 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxcr6Q9EQ16 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxcr6Q9EQ16 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxcr6Q9EQ16 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxcr6Q9EQ16 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxcr6Q9EQ16 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxcr6Q9EQ16 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxcr6Q9EQ16 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxcr6Q9EQ16 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxcr6Q9EQ16 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxcr6Q9EQ16 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxcr6Q9EQ16 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcr6Q9EQ16 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcr6Q9EQ16 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcr6Q9EQ16 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcr6Q9EQ16 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcr6Q9EQ16 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcr6Q9EQ16 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxcr6Q9EQ16 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxcr6Q9EQ16 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cxcr6Q9EQ16 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxcr6Q9EQ16 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxcr6Q9EQ16 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxcr6Q9EQ16 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxcr6Q9EQ16 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcr6Q9EQ16 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcr6Q9EQ16 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcr6Q9EQ16 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcr6Q9EQ16 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcr6Q9EQ16 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcr6Q9EQ16 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcr6Q9EQ16 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcr6Q9EQ16 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcr6Q9EQ16 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcr6Q9EQ16 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcr6Q9EQ16 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcr6Q9EQ16 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcr6Q9EQ16 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcr6Q9EQ16 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcr6Q9EQ16 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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