Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tlr1Q9EPQ1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlr1Q9EPQ1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tlr1Q9EPQ1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Tlr1Q9EPQ1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tlr1Q9EPQ1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tlr1Q9EPQ1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tlr1Q9EPQ1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms