Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP64

Tnmd, Tenomodulin, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnmdQ9EP64 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TnmdQ9EP64 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TnmdQ9EP64 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TnmdQ9EP64 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TnmdQ9EP64 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TnmdQ9EP64 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TnmdQ9EP64 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TnmdQ9EP64 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TnmdQ9EP64 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TnmdQ9EP64 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TnmdQ9EP64 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TnmdQ9EP64 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TnmdQ9EP64 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TnmdQ9EP64 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TnmdQ9EP64 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TnmdQ9EP64 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TnmdQ9EP64 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TnmdQ9EP64 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TnmdQ9EP64 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TnmdQ9EP64 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TnmdQ9EP64 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TnmdQ9EP64 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TnmdQ9EP64 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TnmdQ9EP64 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TnmdQ9EP64 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TnmdQ9EP64 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TnmdQ9EP64 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TnmdQ9EP64 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TnmdQ9EP64 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TnmdQ9EP64 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TnmdQ9EP64 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TnmdQ9EP64 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TnmdQ9EP64 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TnmdQ9EP64 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TnmdQ9EP64 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TnmdQ9EP64 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TnmdQ9EP64 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TnmdQ9EP64 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TnmdQ9EP64 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TnmdQ9EP64 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TnmdQ9EP64 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TnmdQ9EP64 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TnmdQ9EP64 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TnmdQ9EP64 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TnmdQ9EP64 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TnmdQ9EP64 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TnmdQ9EP64 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TnmdQ9EP64 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TnmdQ9EP64 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TnmdQ9EP64 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TnmdQ9EP64 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TnmdQ9EP64 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TnmdQ9EP64 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TnmdQ9EP64 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TnmdQ9EP64 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TnmdQ9EP64 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TnmdQ9EP64 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TnmdQ9EP64 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TnmdQ9EP64 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TnmdQ9EP64 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TnmdQ9EP64 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TnmdQ9EP64 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms