Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SelenooQ9DBC0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SelenooQ9DBC0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SelenooQ9DBC0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SelenooQ9DBC0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SelenooQ9DBC0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SelenooQ9DBC0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SelenooQ9DBC0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SelenooQ9DBC0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SelenooQ9DBC0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SelenooQ9DBC0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SelenooQ9DBC0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SelenooQ9DBC0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SelenooQ9DBC0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SelenooQ9DBC0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SelenooQ9DBC0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SelenooQ9DBC0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SelenooQ9DBC0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SelenooQ9DBC0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SelenooQ9DBC0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SelenooQ9DBC0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SelenooQ9DBC0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SelenooQ9DBC0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SelenooQ9DBC0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SelenooQ9DBC0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SelenooQ9DBC0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SelenooQ9DBC0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SelenooQ9DBC0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SelenooQ9DBC0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SelenooQ9DBC0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SelenooQ9DBC0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SelenooQ9DBC0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SelenooQ9DBC0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SelenooQ9DBC0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SelenooQ9DBC0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SelenooQ9DBC0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SelenooQ9DBC0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SelenooQ9DBC0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SelenooQ9DBC0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SelenooQ9DBC0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SelenooQ9DBC0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SelenooQ9DBC0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SelenooQ9DBC0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SelenooQ9DBC0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SelenooQ9DBC0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SelenooQ9DBC0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SelenooQ9DBC0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SelenooQ9DBC0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SelenooQ9DBC0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SelenooQ9DBC0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SelenooQ9DBC0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SelenooQ9DBC0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SelenooQ9DBC0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SelenooQ9DBC0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SelenooQ9DBC0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SelenooQ9DBC0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SelenooQ9DBC0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SelenooQ9DBC0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SelenooQ9DBC0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SelenooQ9DBC0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SelenooQ9DBC0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SelenooQ9DBC0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SelenooQ9DBC0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SelenooQ9DBC0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SelenooQ9DBC0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SelenooQ9DBC0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SelenooQ9DBC0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SelenooQ9DBC0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SelenooQ9DBC0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SelenooQ9DBC0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SelenooQ9DBC0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SelenooQ9DBC0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SelenooQ9DBC0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SelenooQ9DBC0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SelenooQ9DBC0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SelenooQ9DBC0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SelenooQ9DBC0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SelenooQ9DBC0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SelenooQ9DBC0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SelenooQ9DBC0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SelenooQ9DBC0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SelenooQ9DBC0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SelenooQ9DBC0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SelenooQ9DBC0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SelenooQ9DBC0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SelenooQ9DBC0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SelenooQ9DBC0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SelenooQ9DBC0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SelenooQ9DBC0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SelenooQ9DBC0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SelenooQ9DBC0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SelenooQ9DBC0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SelenooQ9DBC0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SelenooQ9DBC0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SelenooQ9DBC0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SelenooQ9DBC0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SelenooQ9DBC0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SelenooQ9DBC0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SelenooQ9DBC0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SelenooQ9DBC0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.5 ms