Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rhobtb1Q9DAK3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rhobtb1Q9DAK3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rhobtb1Q9DAK3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rhobtb1Q9DAK3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rhobtb1Q9DAK3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rhobtb1Q9DAK3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rhobtb1Q9DAK3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rhobtb1Q9DAK3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rhobtb1Q9DAK3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rhobtb1Q9DAK3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rhobtb1Q9DAK3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rhobtb1Q9DAK3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rhobtb1Q9DAK3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rhobtb1Q9DAK3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rhobtb1Q9DAK3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rhobtb1Q9DAK3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rhobtb1Q9DAK3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rhobtb1Q9DAK3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rhobtb1Q9DAK3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rhobtb1Q9DAK3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rhobtb1Q9DAK3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rhobtb1Q9DAK3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rhobtb1Q9DAK3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rhobtb1Q9DAK3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rhobtb1Q9DAK3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rhobtb1Q9DAK3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rhobtb1Q9DAK3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rhobtb1Q9DAK3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rhobtb1Q9DAK3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rhobtb1Q9DAK3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhobtb1Q9DAK3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhobtb1Q9DAK3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhobtb1Q9DAK3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhobtb1Q9DAK3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhobtb1Q9DAK3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rhobtb1Q9DAK3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rhobtb1Q9DAK3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rhobtb1Q9DAK3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rhobtb1Q9DAK3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rhobtb1Q9DAK3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rhobtb1Q9DAK3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rhobtb1Q9DAK3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhobtb1Q9DAK3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhobtb1Q9DAK3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhobtb1Q9DAK3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhobtb1Q9DAK3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rhobtb1Q9DAK3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rhobtb1Q9DAK3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rhobtb1Q9DAK3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rhobtb1Q9DAK3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rhobtb1Q9DAK3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rhobtb1Q9DAK3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rhobtb1Q9DAK3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rhobtb1Q9DAK3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rhobtb1Q9DAK3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rhobtb1Q9DAK3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rhobtb1Q9DAK3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhobtb1Q9DAK3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhobtb1Q9DAK3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhobtb1Q9DAK3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhobtb1Q9DAK3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhobtb1Q9DAK3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhobtb1Q9DAK3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhobtb1Q9DAK3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhobtb1Q9DAK3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhobtb1Q9DAK3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rhobtb1Q9DAK3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rhobtb1Q9DAK3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rhobtb1Q9DAK3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhobtb1Q9DAK3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhobtb1Q9DAK3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhobtb1Q9DAK3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhobtb1Q9DAK3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhobtb1Q9DAK3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhobtb1Q9DAK3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhobtb1Q9DAK3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhobtb1Q9DAK3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhobtb1Q9DAK3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhobtb1Q9DAK3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhobtb1Q9DAK3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhobtb1Q9DAK3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhobtb1Q9DAK3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhobtb1Q9DAK3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhobtb1Q9DAK3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhobtb1Q9DAK3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhobtb1Q9DAK3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhobtb1Q9DAK3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhobtb1Q9DAK3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rhobtb1Q9DAK3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rhobtb1Q9DAK3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rhobtb1Q9DAK3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rhobtb1Q9DAK3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rhobtb1Q9DAK3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rhobtb1Q9DAK3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhobtb1Q9DAK3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhobtb1Q9DAK3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhobtb1Q9DAK3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms