Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Z6

Atg101, Autophagy-related protein 101, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg101Q9D8Z6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg101Q9D8Z6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg101Q9D8Z6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg101Q9D8Z6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg101Q9D8Z6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg101Q9D8Z6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atg101Q9D8Z6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atg101Q9D8Z6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg101Q9D8Z6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg101Q9D8Z6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg101Q9D8Z6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg101Q9D8Z6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg101Q9D8Z6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg101Q9D8Z6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg101Q9D8Z6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg101Q9D8Z6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg101Q9D8Z6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg101Q9D8Z6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg101Q9D8Z6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg101Q9D8Z6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg101Q9D8Z6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg101Q9D8Z6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg101Q9D8Z6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg101Q9D8Z6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg101Q9D8Z6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg101Q9D8Z6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg101Q9D8Z6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg101Q9D8Z6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg101Q9D8Z6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg101Q9D8Z6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg101Q9D8Z6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg101Q9D8Z6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg101Q9D8Z6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg101Q9D8Z6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg101Q9D8Z6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg101Q9D8Z6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg101Q9D8Z6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg101Q9D8Z6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg101Q9D8Z6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atg101Q9D8Z6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg101Q9D8Z6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg101Q9D8Z6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg101Q9D8Z6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg101Q9D8Z6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg101Q9D8Z6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg101Q9D8Z6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg101Q9D8Z6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg101Q9D8Z6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg101Q9D8Z6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg101Q9D8Z6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg101Q9D8Z6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg101Q9D8Z6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg101Q9D8Z6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg101Q9D8Z6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg101Q9D8Z6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg101Q9D8Z6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg101Q9D8Z6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg101Q9D8Z6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg101Q9D8Z6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg101Q9D8Z6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg101Q9D8Z6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg101Q9D8Z6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg101Q9D8Z6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg101Q9D8Z6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms