Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfrsf13cQ9D8D0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfrsf13cQ9D8D0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfrsf13cQ9D8D0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfrsf13cQ9D8D0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf13cQ9D8D0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf13cQ9D8D0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf13cQ9D8D0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf13cQ9D8D0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf13cQ9D8D0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf13cQ9D8D0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf13cQ9D8D0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf13cQ9D8D0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf13cQ9D8D0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf13cQ9D8D0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf13cQ9D8D0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms