Protein–RNA interactions for Protein: Q9D809

2200002D01Rik, MCG22941, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2200002D01RikQ9D809 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
2200002D01RikQ9D809 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
2200002D01RikQ9D809 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
2200002D01RikQ9D809 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
2200002D01RikQ9D809 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
2200002D01RikQ9D809 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
2200002D01RikQ9D809 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
2200002D01RikQ9D809 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
2200002D01RikQ9D809 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
2200002D01RikQ9D809 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
2200002D01RikQ9D809 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
2200002D01RikQ9D809 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
2200002D01RikQ9D809 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
2200002D01RikQ9D809 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
2200002D01RikQ9D809 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
2200002D01RikQ9D809 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
2200002D01RikQ9D809 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
2200002D01RikQ9D809 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
2200002D01RikQ9D809 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
2200002D01RikQ9D809 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
2200002D01RikQ9D809 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
2200002D01RikQ9D809 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
2200002D01RikQ9D809 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
2200002D01RikQ9D809 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
2200002D01RikQ9D809 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
2200002D01RikQ9D809 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
2200002D01RikQ9D809 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
2200002D01RikQ9D809 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
2200002D01RikQ9D809 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
2200002D01RikQ9D809 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
2200002D01RikQ9D809 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
2200002D01RikQ9D809 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
2200002D01RikQ9D809 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
2200002D01RikQ9D809 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
2200002D01RikQ9D809 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
2200002D01RikQ9D809 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
2200002D01RikQ9D809 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
2200002D01RikQ9D809 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
2200002D01RikQ9D809 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
2200002D01RikQ9D809 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
2200002D01RikQ9D809 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
2200002D01RikQ9D809 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
2200002D01RikQ9D809 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
2200002D01RikQ9D809 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
2200002D01RikQ9D809 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
2200002D01RikQ9D809 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
2200002D01RikQ9D809 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
2200002D01RikQ9D809 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
2200002D01RikQ9D809 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
2200002D01RikQ9D809 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
2200002D01RikQ9D809 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
2200002D01RikQ9D809 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
2200002D01RikQ9D809 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
2200002D01RikQ9D809 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
2200002D01RikQ9D809 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
2200002D01RikQ9D809 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
2200002D01RikQ9D809 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
2200002D01RikQ9D809 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
2200002D01RikQ9D809 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
2200002D01RikQ9D809 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
2200002D01RikQ9D809 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
2200002D01RikQ9D809 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
2200002D01RikQ9D809 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
2200002D01RikQ9D809 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
2200002D01RikQ9D809 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
2200002D01RikQ9D809 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
2200002D01RikQ9D809 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
2200002D01RikQ9D809 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
2200002D01RikQ9D809 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
2200002D01RikQ9D809 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
2200002D01RikQ9D809 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
2200002D01RikQ9D809 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
2200002D01RikQ9D809 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
2200002D01RikQ9D809 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
2200002D01RikQ9D809 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
2200002D01RikQ9D809 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
2200002D01RikQ9D809 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
2200002D01RikQ9D809 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
2200002D01RikQ9D809 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
2200002D01RikQ9D809 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
2200002D01RikQ9D809 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
2200002D01RikQ9D809 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
2200002D01RikQ9D809 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
2200002D01RikQ9D809 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
2200002D01RikQ9D809 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
2200002D01RikQ9D809 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
2200002D01RikQ9D809 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
2200002D01RikQ9D809 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
2200002D01RikQ9D809 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
2200002D01RikQ9D809 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
2200002D01RikQ9D809 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
2200002D01RikQ9D809 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
2200002D01RikQ9D809 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
2200002D01RikQ9D809 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
2200002D01RikQ9D809 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
2200002D01RikQ9D809 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
2200002D01RikQ9D809 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
2200002D01RikQ9D809 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
2200002D01RikQ9D809 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
2200002D01RikQ9D809 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms