Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MsraQ9D6Y7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MsraQ9D6Y7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MsraQ9D6Y7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MsraQ9D6Y7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MsraQ9D6Y7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MsraQ9D6Y7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MsraQ9D6Y7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MsraQ9D6Y7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MsraQ9D6Y7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MsraQ9D6Y7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MsraQ9D6Y7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MsraQ9D6Y7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MsraQ9D6Y7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MsraQ9D6Y7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MsraQ9D6Y7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MsraQ9D6Y7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MsraQ9D6Y7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MsraQ9D6Y7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MsraQ9D6Y7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MsraQ9D6Y7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MsraQ9D6Y7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MsraQ9D6Y7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MsraQ9D6Y7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MsraQ9D6Y7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MsraQ9D6Y7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MsraQ9D6Y7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MsraQ9D6Y7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MsraQ9D6Y7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MsraQ9D6Y7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MsraQ9D6Y7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MsraQ9D6Y7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MsraQ9D6Y7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MsraQ9D6Y7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MsraQ9D6Y7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MsraQ9D6Y7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MsraQ9D6Y7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MsraQ9D6Y7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MsraQ9D6Y7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MsraQ9D6Y7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MsraQ9D6Y7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MsraQ9D6Y7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MsraQ9D6Y7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MsraQ9D6Y7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MsraQ9D6Y7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MsraQ9D6Y7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MsraQ9D6Y7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MsraQ9D6Y7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MsraQ9D6Y7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MsraQ9D6Y7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MsraQ9D6Y7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MsraQ9D6Y7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MsraQ9D6Y7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MsraQ9D6Y7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MsraQ9D6Y7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MsraQ9D6Y7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MsraQ9D6Y7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MsraQ9D6Y7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MsraQ9D6Y7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MsraQ9D6Y7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MsraQ9D6Y7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MsraQ9D6Y7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MsraQ9D6Y7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
MsraQ9D6Y7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MsraQ9D6Y7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MsraQ9D6Y7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MsraQ9D6Y7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MsraQ9D6Y7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MsraQ9D6Y7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MsraQ9D6Y7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MsraQ9D6Y7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MsraQ9D6Y7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MsraQ9D6Y7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MsraQ9D6Y7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MsraQ9D6Y7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MsraQ9D6Y7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MsraQ9D6Y7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MsraQ9D6Y7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MsraQ9D6Y7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MsraQ9D6Y7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MsraQ9D6Y7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MsraQ9D6Y7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MsraQ9D6Y7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MsraQ9D6Y7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MsraQ9D6Y7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MsraQ9D6Y7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MsraQ9D6Y7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MsraQ9D6Y7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MsraQ9D6Y7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MsraQ9D6Y7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MsraQ9D6Y7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MsraQ9D6Y7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MsraQ9D6Y7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MsraQ9D6Y7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MsraQ9D6Y7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MsraQ9D6Y7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MsraQ9D6Y7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MsraQ9D6Y7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MsraQ9D6Y7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MsraQ9D6Y7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms