Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W6

Slco6d1, MCG6225, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco6d1Q9D5W6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slco6d1Q9D5W6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slco6d1Q9D5W6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slco6d1Q9D5W6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slco6d1Q9D5W6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slco6d1Q9D5W6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slco6d1Q9D5W6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slco6d1Q9D5W6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slco6d1Q9D5W6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slco6d1Q9D5W6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slco6d1Q9D5W6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slco6d1Q9D5W6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slco6d1Q9D5W6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slco6d1Q9D5W6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slco6d1Q9D5W6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slco6d1Q9D5W6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slco6d1Q9D5W6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slco6d1Q9D5W6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slco6d1Q9D5W6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slco6d1Q9D5W6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slco6d1Q9D5W6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slco6d1Q9D5W6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slco6d1Q9D5W6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slco6d1Q9D5W6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slco6d1Q9D5W6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slco6d1Q9D5W6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slco6d1Q9D5W6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slco6d1Q9D5W6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Slco6d1Q9D5W6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slco6d1Q9D5W6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Slco6d1Q9D5W6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slco6d1Q9D5W6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slco6d1Q9D5W6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slco6d1Q9D5W6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slco6d1Q9D5W6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slco6d1Q9D5W6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Slco6d1Q9D5W6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slco6d1Q9D5W6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slco6d1Q9D5W6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slco6d1Q9D5W6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slco6d1Q9D5W6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slco6d1Q9D5W6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slco6d1Q9D5W6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slco6d1Q9D5W6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slco6d1Q9D5W6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slco6d1Q9D5W6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slco6d1Q9D5W6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slco6d1Q9D5W6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slco6d1Q9D5W6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slco6d1Q9D5W6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slco6d1Q9D5W6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slco6d1Q9D5W6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Slco6d1Q9D5W6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slco6d1Q9D5W6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slco6d1Q9D5W6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slco6d1Q9D5W6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slco6d1Q9D5W6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slco6d1Q9D5W6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slco6d1Q9D5W6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slco6d1Q9D5W6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slco6d1Q9D5W6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slco6d1Q9D5W6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slco6d1Q9D5W6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slco6d1Q9D5W6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slco6d1Q9D5W6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slco6d1Q9D5W6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slco6d1Q9D5W6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slco6d1Q9D5W6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slco6d1Q9D5W6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slco6d1Q9D5W6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slco6d1Q9D5W6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slco6d1Q9D5W6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slco6d1Q9D5W6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slco6d1Q9D5W6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slco6d1Q9D5W6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slco6d1Q9D5W6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slco6d1Q9D5W6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slco6d1Q9D5W6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slco6d1Q9D5W6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slco6d1Q9D5W6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slco6d1Q9D5W6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slco6d1Q9D5W6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slco6d1Q9D5W6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slco6d1Q9D5W6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slco6d1Q9D5W6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slco6d1Q9D5W6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slco6d1Q9D5W6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slco6d1Q9D5W6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slco6d1Q9D5W6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slco6d1Q9D5W6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slco6d1Q9D5W6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slco6d1Q9D5W6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slco6d1Q9D5W6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slco6d1Q9D5W6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slco6d1Q9D5W6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slco6d1Q9D5W6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slco6d1Q9D5W6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slco6d1Q9D5W6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slco6d1Q9D5W6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slco6d1Q9D5W6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms