Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4930578G10RikQ9D4Q4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930578G10RikQ9D4Q4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
4930578G10RikQ9D4Q4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930578G10RikQ9D4Q4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
4930578G10RikQ9D4Q4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
4930578G10RikQ9D4Q4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930578G10RikQ9D4Q4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930578G10RikQ9D4Q4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930578G10RikQ9D4Q4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
4930578G10RikQ9D4Q4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms