Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4933428M09RikQ9D3X3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4933428M09RikQ9D3X3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4933428M09RikQ9D3X3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
4933428M09RikQ9D3X3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4933428M09RikQ9D3X3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4933428M09RikQ9D3X3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4933428M09RikQ9D3X3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4933428M09RikQ9D3X3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4933428M09RikQ9D3X3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
4933428M09RikQ9D3X3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
4933428M09RikQ9D3X3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4933428M09RikQ9D3X3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
4933428M09RikQ9D3X3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4933428M09RikQ9D3X3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4933428M09RikQ9D3X3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
4933428M09RikQ9D3X3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4933428M09RikQ9D3X3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4933428M09RikQ9D3X3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4933428M09RikQ9D3X3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4933428M09RikQ9D3X3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4933428M09RikQ9D3X3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4933428M09RikQ9D3X3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4933428M09RikQ9D3X3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4933428M09RikQ9D3X3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
4933428M09RikQ9D3X3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
4933428M09RikQ9D3X3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4933428M09RikQ9D3X3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
4933428M09RikQ9D3X3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4933428M09RikQ9D3X3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4933428M09RikQ9D3X3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4933428M09RikQ9D3X3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
4933428M09RikQ9D3X3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4933428M09RikQ9D3X3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23■■□□□ 1.27
4933428M09RikQ9D3X3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
4933428M09RikQ9D3X3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
4933428M09RikQ9D3X3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
4933428M09RikQ9D3X3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4933428M09RikQ9D3X3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4933428M09RikQ9D3X3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4933428M09RikQ9D3X3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4933428M09RikQ9D3X3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4933428M09RikQ9D3X3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4933428M09RikQ9D3X3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4933428M09RikQ9D3X3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4933428M09RikQ9D3X3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
4933428M09RikQ9D3X3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4933428M09RikQ9D3X3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4933428M09RikQ9D3X3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4933428M09RikQ9D3X3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
4933428M09RikQ9D3X3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4933428M09RikQ9D3X3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933428M09RikQ9D3X3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933428M09RikQ9D3X3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933428M09RikQ9D3X3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933428M09RikQ9D3X3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933428M09RikQ9D3X3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
4933428M09RikQ9D3X3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
4933428M09RikQ9D3X3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4933428M09RikQ9D3X3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4933428M09RikQ9D3X3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4933428M09RikQ9D3X3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
4933428M09RikQ9D3X3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4933428M09RikQ9D3X3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4933428M09RikQ9D3X3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
4933428M09RikQ9D3X3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4933428M09RikQ9D3X3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4933428M09RikQ9D3X3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933428M09RikQ9D3X3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933428M09RikQ9D3X3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933428M09RikQ9D3X3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933428M09RikQ9D3X3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933428M09RikQ9D3X3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933428M09RikQ9D3X3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933428M09RikQ9D3X3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933428M09RikQ9D3X3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933428M09RikQ9D3X3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933428M09RikQ9D3X3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933428M09RikQ9D3X3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933428M09RikQ9D3X3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933428M09RikQ9D3X3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933428M09RikQ9D3X3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933428M09RikQ9D3X3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933428M09RikQ9D3X3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933428M09RikQ9D3X3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933428M09RikQ9D3X3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933428M09RikQ9D3X3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933428M09RikQ9D3X3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933428M09RikQ9D3X3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933428M09RikQ9D3X3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933428M09RikQ9D3X3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933428M09RikQ9D3X3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933428M09RikQ9D3X3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933428M09RikQ9D3X3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933428M09RikQ9D3X3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms