Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rasgef1cQ9D300 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rasgef1cQ9D300 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rasgef1cQ9D300 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rasgef1cQ9D300 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rasgef1cQ9D300 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rasgef1cQ9D300 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rasgef1cQ9D300 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rasgef1cQ9D300 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rasgef1cQ9D300 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rasgef1cQ9D300 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rasgef1cQ9D300 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rasgef1cQ9D300 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rasgef1cQ9D300 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rasgef1cQ9D300 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rasgef1cQ9D300 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rasgef1cQ9D300 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rasgef1cQ9D300 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rasgef1cQ9D300 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rasgef1cQ9D300 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rasgef1cQ9D300 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Rasgef1cQ9D300 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Rasgef1cQ9D300 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rasgef1cQ9D300 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rasgef1cQ9D300 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rasgef1cQ9D300 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rasgef1cQ9D300 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rasgef1cQ9D300 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rasgef1cQ9D300 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rasgef1cQ9D300 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rasgef1cQ9D300 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rasgef1cQ9D300 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rasgef1cQ9D300 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rasgef1cQ9D300 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rasgef1cQ9D300 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rasgef1cQ9D300 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rasgef1cQ9D300 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rasgef1cQ9D300 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rasgef1cQ9D300 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rasgef1cQ9D300 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rasgef1cQ9D300 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rasgef1cQ9D300 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rasgef1cQ9D300 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rasgef1cQ9D300 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rasgef1cQ9D300 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rasgef1cQ9D300 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rasgef1cQ9D300 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rasgef1cQ9D300 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rasgef1cQ9D300 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rasgef1cQ9D300 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rasgef1cQ9D300 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rasgef1cQ9D300 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rasgef1cQ9D300 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rasgef1cQ9D300 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rasgef1cQ9D300 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rasgef1cQ9D300 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rasgef1cQ9D300 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rasgef1cQ9D300 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rasgef1cQ9D300 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rasgef1cQ9D300 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rasgef1cQ9D300 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rasgef1cQ9D300 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rasgef1cQ9D300 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rasgef1cQ9D300 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rasgef1cQ9D300 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rasgef1cQ9D300 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rasgef1cQ9D300 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rasgef1cQ9D300 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rasgef1cQ9D300 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rasgef1cQ9D300 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rasgef1cQ9D300 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rasgef1cQ9D300 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rasgef1cQ9D300 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rasgef1cQ9D300 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rasgef1cQ9D300 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rasgef1cQ9D300 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rasgef1cQ9D300 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rasgef1cQ9D300 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rasgef1cQ9D300 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rasgef1cQ9D300 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rasgef1cQ9D300 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rasgef1cQ9D300 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rasgef1cQ9D300 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rasgef1cQ9D300 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rasgef1cQ9D300 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rasgef1cQ9D300 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rasgef1cQ9D300 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rasgef1cQ9D300 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rasgef1cQ9D300 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rasgef1cQ9D300 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rasgef1cQ9D300 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rasgef1cQ9D300 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rasgef1cQ9D300 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rasgef1cQ9D300 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rasgef1cQ9D300 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rasgef1cQ9D300 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rasgef1cQ9D300 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rasgef1cQ9D300 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rasgef1cQ9D300 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rasgef1cQ9D300 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms