Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1T0

Lingo1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo1Q9D1T0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lingo1Q9D1T0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lingo1Q9D1T0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lingo1Q9D1T0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lingo1Q9D1T0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lingo1Q9D1T0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lingo1Q9D1T0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lingo1Q9D1T0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lingo1Q9D1T0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lingo1Q9D1T0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lingo1Q9D1T0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lingo1Q9D1T0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lingo1Q9D1T0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lingo1Q9D1T0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lingo1Q9D1T0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lingo1Q9D1T0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lingo1Q9D1T0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lingo1Q9D1T0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lingo1Q9D1T0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lingo1Q9D1T0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lingo1Q9D1T0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lingo1Q9D1T0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lingo1Q9D1T0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lingo1Q9D1T0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lingo1Q9D1T0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lingo1Q9D1T0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lingo1Q9D1T0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lingo1Q9D1T0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Lingo1Q9D1T0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lingo1Q9D1T0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lingo1Q9D1T0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lingo1Q9D1T0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lingo1Q9D1T0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lingo1Q9D1T0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lingo1Q9D1T0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lingo1Q9D1T0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lingo1Q9D1T0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lingo1Q9D1T0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Lingo1Q9D1T0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lingo1Q9D1T0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lingo1Q9D1T0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lingo1Q9D1T0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lingo1Q9D1T0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lingo1Q9D1T0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lingo1Q9D1T0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lingo1Q9D1T0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lingo1Q9D1T0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lingo1Q9D1T0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lingo1Q9D1T0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lingo1Q9D1T0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lingo1Q9D1T0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lingo1Q9D1T0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lingo1Q9D1T0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lingo1Q9D1T0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lingo1Q9D1T0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lingo1Q9D1T0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lingo1Q9D1T0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lingo1Q9D1T0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lingo1Q9D1T0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lingo1Q9D1T0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lingo1Q9D1T0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lingo1Q9D1T0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Lingo1Q9D1T0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Lingo1Q9D1T0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lingo1Q9D1T0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lingo1Q9D1T0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lingo1Q9D1T0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Lingo1Q9D1T0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lingo1Q9D1T0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lingo1Q9D1T0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lingo1Q9D1T0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lingo1Q9D1T0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Lingo1Q9D1T0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lingo1Q9D1T0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lingo1Q9D1T0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lingo1Q9D1T0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lingo1Q9D1T0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lingo1Q9D1T0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lingo1Q9D1T0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lingo1Q9D1T0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lingo1Q9D1T0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lingo1Q9D1T0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lingo1Q9D1T0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lingo1Q9D1T0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lingo1Q9D1T0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lingo1Q9D1T0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lingo1Q9D1T0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lingo1Q9D1T0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lingo1Q9D1T0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lingo1Q9D1T0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lingo1Q9D1T0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lingo1Q9D1T0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lingo1Q9D1T0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lingo1Q9D1T0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lingo1Q9D1T0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lingo1Q9D1T0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lingo1Q9D1T0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lingo1Q9D1T0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lingo1Q9D1T0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lingo1Q9D1T0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms