Protein–RNA interactions for Protein: Q9D131

UPF0686 protein C11orf1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D131 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D131 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D131 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D131 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D131 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D131 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D131 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D131 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D131 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D131 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D131 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D131 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D131 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D131 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D131 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D131 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D131 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D131 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D131 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D131 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D131 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D131 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D131 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D131 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D131 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D131 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D131 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D131 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D131 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D131 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D131 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D131 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D131 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D131 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D131 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D131 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D131 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D131 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D131 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D131 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D131 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D131 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D131 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D131 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D131 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D131 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D131 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D131 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D131 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D131 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D131 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D131 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D131 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D131 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D131 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D131 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D131 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D131 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D131 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D131 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D131 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D131 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D131 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D131 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D131 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D131 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D131 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D131 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D131 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D131 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D131 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D131 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D131 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D131 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D131 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D131 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D131 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D131 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D131 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D131 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D131 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D131 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D131 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D131 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D131 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D131 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D131 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D131 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D131 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D131 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D131 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D131 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D131 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D131 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D131 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D131 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D131 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D131 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D131 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D131 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms