Protein–RNA interactions for Protein: Q9D103

Ifitm1, Interferon-induced transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm1Q9D103 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifitm1Q9D103 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifitm1Q9D103 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifitm1Q9D103 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifitm1Q9D103 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifitm1Q9D103 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifitm1Q9D103 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifitm1Q9D103 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifitm1Q9D103 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifitm1Q9D103 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifitm1Q9D103 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifitm1Q9D103 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifitm1Q9D103 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifitm1Q9D103 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifitm1Q9D103 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifitm1Q9D103 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifitm1Q9D103 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifitm1Q9D103 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifitm1Q9D103 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifitm1Q9D103 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifitm1Q9D103 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifitm1Q9D103 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifitm1Q9D103 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifitm1Q9D103 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifitm1Q9D103 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifitm1Q9D103 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifitm1Q9D103 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifitm1Q9D103 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifitm1Q9D103 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifitm1Q9D103 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifitm1Q9D103 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifitm1Q9D103 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifitm1Q9D103 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifitm1Q9D103 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifitm1Q9D103 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifitm1Q9D103 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifitm1Q9D103 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifitm1Q9D103 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifitm1Q9D103 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifitm1Q9D103 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifitm1Q9D103 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifitm1Q9D103 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifitm1Q9D103 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifitm1Q9D103 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifitm1Q9D103 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifitm1Q9D103 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifitm1Q9D103 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifitm1Q9D103 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifitm1Q9D103 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifitm1Q9D103 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifitm1Q9D103 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifitm1Q9D103 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifitm1Q9D103 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifitm1Q9D103 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifitm1Q9D103 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifitm1Q9D103 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifitm1Q9D103 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifitm1Q9D103 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifitm1Q9D103 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifitm1Q9D103 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifitm1Q9D103 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifitm1Q9D103 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifitm1Q9D103 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifitm1Q9D103 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifitm1Q9D103 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifitm1Q9D103 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifitm1Q9D103 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifitm1Q9D103 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifitm1Q9D103 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifitm1Q9D103 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifitm1Q9D103 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifitm1Q9D103 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifitm1Q9D103 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ifitm1Q9D103 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ifitm1Q9D103 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifitm1Q9D103 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifitm1Q9D103 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifitm1Q9D103 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifitm1Q9D103 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifitm1Q9D103 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifitm1Q9D103 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifitm1Q9D103 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifitm1Q9D103 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifitm1Q9D103 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifitm1Q9D103 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifitm1Q9D103 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifitm1Q9D103 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifitm1Q9D103 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifitm1Q9D103 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifitm1Q9D103 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifitm1Q9D103 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifitm1Q9D103 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifitm1Q9D103 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifitm1Q9D103 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifitm1Q9D103 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifitm1Q9D103 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifitm1Q9D103 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifitm1Q9D103 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifitm1Q9D103 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifitm1Q9D103 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms