Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B0

Srsf9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf9Q9D0B0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf9Q9D0B0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf9Q9D0B0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf9Q9D0B0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf9Q9D0B0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf9Q9D0B0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srsf9Q9D0B0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srsf9Q9D0B0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srsf9Q9D0B0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Srsf9Q9D0B0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srsf9Q9D0B0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srsf9Q9D0B0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srsf9Q9D0B0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srsf9Q9D0B0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srsf9Q9D0B0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srsf9Q9D0B0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srsf9Q9D0B0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srsf9Q9D0B0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srsf9Q9D0B0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srsf9Q9D0B0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srsf9Q9D0B0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srsf9Q9D0B0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srsf9Q9D0B0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srsf9Q9D0B0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srsf9Q9D0B0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srsf9Q9D0B0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srsf9Q9D0B0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srsf9Q9D0B0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srsf9Q9D0B0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srsf9Q9D0B0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srsf9Q9D0B0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Srsf9Q9D0B0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srsf9Q9D0B0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srsf9Q9D0B0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srsf9Q9D0B0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srsf9Q9D0B0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srsf9Q9D0B0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srsf9Q9D0B0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srsf9Q9D0B0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Srsf9Q9D0B0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srsf9Q9D0B0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srsf9Q9D0B0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Srsf9Q9D0B0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srsf9Q9D0B0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Srsf9Q9D0B0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srsf9Q9D0B0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srsf9Q9D0B0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srsf9Q9D0B0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srsf9Q9D0B0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srsf9Q9D0B0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Srsf9Q9D0B0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srsf9Q9D0B0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srsf9Q9D0B0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Srsf9Q9D0B0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Srsf9Q9D0B0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srsf9Q9D0B0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srsf9Q9D0B0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srsf9Q9D0B0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srsf9Q9D0B0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srsf9Q9D0B0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srsf9Q9D0B0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srsf9Q9D0B0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf9Q9D0B0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf9Q9D0B0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srsf9Q9D0B0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srsf9Q9D0B0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srsf9Q9D0B0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srsf9Q9D0B0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srsf9Q9D0B0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srsf9Q9D0B0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srsf9Q9D0B0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srsf9Q9D0B0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srsf9Q9D0B0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srsf9Q9D0B0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf9Q9D0B0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf9Q9D0B0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf9Q9D0B0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf9Q9D0B0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf9Q9D0B0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf9Q9D0B0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf9Q9D0B0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf9Q9D0B0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Srsf9Q9D0B0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf9Q9D0B0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf9Q9D0B0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf9Q9D0B0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf9Q9D0B0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf9Q9D0B0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf9Q9D0B0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srsf9Q9D0B0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srsf9Q9D0B0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srsf9Q9D0B0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srsf9Q9D0B0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srsf9Q9D0B0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srsf9Q9D0B0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srsf9Q9D0B0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srsf9Q9D0B0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srsf9Q9D0B0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srsf9Q9D0B0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srsf9Q9D0B0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms