Protein–RNA interactions for Protein: Q9D074

Mgrn1, E3 ubiquitin-protein ligase MGRN1, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgrn1Q9D074 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Mgrn1Q9D074 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mgrn1Q9D074 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mgrn1Q9D074 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mgrn1Q9D074 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mgrn1Q9D074 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mgrn1Q9D074 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mgrn1Q9D074 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mgrn1Q9D074 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mgrn1Q9D074 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mgrn1Q9D074 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mgrn1Q9D074 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mgrn1Q9D074 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mgrn1Q9D074 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mgrn1Q9D074 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mgrn1Q9D074 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mgrn1Q9D074 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mgrn1Q9D074 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mgrn1Q9D074 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mgrn1Q9D074 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mgrn1Q9D074 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mgrn1Q9D074 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mgrn1Q9D074 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mgrn1Q9D074 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mgrn1Q9D074 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Mgrn1Q9D074 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mgrn1Q9D074 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Mgrn1Q9D074 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mgrn1Q9D074 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mgrn1Q9D074 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mgrn1Q9D074 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mgrn1Q9D074 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mgrn1Q9D074 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mgrn1Q9D074 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mgrn1Q9D074 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mgrn1Q9D074 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mgrn1Q9D074 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mgrn1Q9D074 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mgrn1Q9D074 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mgrn1Q9D074 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mgrn1Q9D074 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mgrn1Q9D074 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mgrn1Q9D074 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mgrn1Q9D074 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mgrn1Q9D074 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mgrn1Q9D074 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mgrn1Q9D074 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Mgrn1Q9D074 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mgrn1Q9D074 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Mgrn1Q9D074 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mgrn1Q9D074 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mgrn1Q9D074 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mgrn1Q9D074 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mgrn1Q9D074 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mgrn1Q9D074 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mgrn1Q9D074 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mgrn1Q9D074 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mgrn1Q9D074 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mgrn1Q9D074 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mgrn1Q9D074 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mgrn1Q9D074 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mgrn1Q9D074 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mgrn1Q9D074 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mgrn1Q9D074 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mgrn1Q9D074 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mgrn1Q9D074 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mgrn1Q9D074 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mgrn1Q9D074 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mgrn1Q9D074 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mgrn1Q9D074 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mgrn1Q9D074 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mgrn1Q9D074 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mgrn1Q9D074 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mgrn1Q9D074 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mgrn1Q9D074 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mgrn1Q9D074 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mgrn1Q9D074 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mgrn1Q9D074 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mgrn1Q9D074 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mgrn1Q9D074 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mgrn1Q9D074 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mgrn1Q9D074 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mgrn1Q9D074 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mgrn1Q9D074 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mgrn1Q9D074 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mgrn1Q9D074 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mgrn1Q9D074 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mgrn1Q9D074 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mgrn1Q9D074 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Mgrn1Q9D074 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mgrn1Q9D074 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mgrn1Q9D074 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mgrn1Q9D074 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mgrn1Q9D074 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mgrn1Q9D074 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mgrn1Q9D074 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mgrn1Q9D074 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mgrn1Q9D074 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mgrn1Q9D074 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mgrn1Q9D074 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms