Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube2fQ9CY34 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube2fQ9CY34 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube2fQ9CY34 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube2fQ9CY34 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube2fQ9CY34 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube2fQ9CY34 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube2fQ9CY34 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube2fQ9CY34 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube2fQ9CY34 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube2fQ9CY34 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube2fQ9CY34 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube2fQ9CY34 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube2fQ9CY34 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube2fQ9CY34 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube2fQ9CY34 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube2fQ9CY34 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube2fQ9CY34 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube2fQ9CY34 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube2fQ9CY34 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube2fQ9CY34 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube2fQ9CY34 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube2fQ9CY34 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube2fQ9CY34 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube2fQ9CY34 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube2fQ9CY34 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube2fQ9CY34 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube2fQ9CY34 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube2fQ9CY34 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube2fQ9CY34 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube2fQ9CY34 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube2fQ9CY34 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Ube2fQ9CY34 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2fQ9CY34 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2fQ9CY34 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube2fQ9CY34 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube2fQ9CY34 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ube2fQ9CY34 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube2fQ9CY34 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2fQ9CY34 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2fQ9CY34 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ube2fQ9CY34 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2fQ9CY34 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2fQ9CY34 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2fQ9CY34 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2fQ9CY34 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube2fQ9CY34 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube2fQ9CY34 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube2fQ9CY34 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube2fQ9CY34 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube2fQ9CY34 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube2fQ9CY34 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2fQ9CY34 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2fQ9CY34 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2fQ9CY34 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube2fQ9CY34 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ube2fQ9CY34 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube2fQ9CY34 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube2fQ9CY34 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube2fQ9CY34 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube2fQ9CY34 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ube2fQ9CY34 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube2fQ9CY34 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube2fQ9CY34 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube2fQ9CY34 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube2fQ9CY34 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2fQ9CY34 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2fQ9CY34 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2fQ9CY34 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2fQ9CY34 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube2fQ9CY34 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube2fQ9CY34 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube2fQ9CY34 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube2fQ9CY34 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube2fQ9CY34 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube2fQ9CY34 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube2fQ9CY34 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ube2fQ9CY34 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ube2fQ9CY34 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ube2fQ9CY34 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ube2fQ9CY34 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ube2fQ9CY34 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ube2fQ9CY34 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ube2fQ9CY34 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ube2fQ9CY34 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ube2fQ9CY34 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ube2fQ9CY34 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ube2fQ9CY34 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ube2fQ9CY34 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ube2fQ9CY34 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ube2fQ9CY34 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube2fQ9CY34 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube2fQ9CY34 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube2fQ9CY34 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube2fQ9CY34 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube2fQ9CY34 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube2fQ9CY34 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube2fQ9CY34 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube2fQ9CY34 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube2fQ9CY34 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms