Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX80

Cygb, Cytoglobin, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CygbQ9CX80 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CygbQ9CX80 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CygbQ9CX80 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CygbQ9CX80 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CygbQ9CX80 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CygbQ9CX80 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CygbQ9CX80 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CygbQ9CX80 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CygbQ9CX80 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CygbQ9CX80 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CygbQ9CX80 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CygbQ9CX80 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CygbQ9CX80 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CygbQ9CX80 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CygbQ9CX80 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CygbQ9CX80 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CygbQ9CX80 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CygbQ9CX80 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CygbQ9CX80 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CygbQ9CX80 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CygbQ9CX80 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CygbQ9CX80 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CygbQ9CX80 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CygbQ9CX80 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CygbQ9CX80 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CygbQ9CX80 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CygbQ9CX80 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CygbQ9CX80 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CygbQ9CX80 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CygbQ9CX80 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CygbQ9CX80 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CygbQ9CX80 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CygbQ9CX80 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CygbQ9CX80 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CygbQ9CX80 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CygbQ9CX80 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CygbQ9CX80 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CygbQ9CX80 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CygbQ9CX80 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CygbQ9CX80 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CygbQ9CX80 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CygbQ9CX80 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CygbQ9CX80 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CygbQ9CX80 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CygbQ9CX80 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CygbQ9CX80 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CygbQ9CX80 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CygbQ9CX80 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CygbQ9CX80 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CygbQ9CX80 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CygbQ9CX80 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CygbQ9CX80 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CygbQ9CX80 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CygbQ9CX80 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CygbQ9CX80 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CygbQ9CX80 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CygbQ9CX80 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CygbQ9CX80 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CygbQ9CX80 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CygbQ9CX80 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CygbQ9CX80 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CygbQ9CX80 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CygbQ9CX80 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CygbQ9CX80 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CygbQ9CX80 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CygbQ9CX80 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CygbQ9CX80 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CygbQ9CX80 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CygbQ9CX80 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CygbQ9CX80 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CygbQ9CX80 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CygbQ9CX80 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CygbQ9CX80 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CygbQ9CX80 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CygbQ9CX80 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CygbQ9CX80 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CygbQ9CX80 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CygbQ9CX80 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CygbQ9CX80 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CygbQ9CX80 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CygbQ9CX80 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CygbQ9CX80 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CygbQ9CX80 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CygbQ9CX80 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CygbQ9CX80 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CygbQ9CX80 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CygbQ9CX80 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CygbQ9CX80 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CygbQ9CX80 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CygbQ9CX80 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CygbQ9CX80 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CygbQ9CX80 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CygbQ9CX80 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CygbQ9CX80 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CygbQ9CX80 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CygbQ9CX80 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CygbQ9CX80 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CygbQ9CX80 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CygbQ9CX80 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CygbQ9CX80 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms