Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cxxc1Q9CWW7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cxxc1Q9CWW7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cxxc1Q9CWW7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cxxc1Q9CWW7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cxxc1Q9CWW7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cxxc1Q9CWW7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cxxc1Q9CWW7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cxxc1Q9CWW7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cxxc1Q9CWW7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cxxc1Q9CWW7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cxxc1Q9CWW7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cxxc1Q9CWW7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cxxc1Q9CWW7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cxxc1Q9CWW7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cxxc1Q9CWW7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cxxc1Q9CWW7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cxxc1Q9CWW7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cxxc1Q9CWW7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cxxc1Q9CWW7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cxxc1Q9CWW7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cxxc1Q9CWW7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cxxc1Q9CWW7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cxxc1Q9CWW7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cxxc1Q9CWW7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cxxc1Q9CWW7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cxxc1Q9CWW7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cxxc1Q9CWW7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cxxc1Q9CWW7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cxxc1Q9CWW7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cxxc1Q9CWW7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cxxc1Q9CWW7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cxxc1Q9CWW7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cxxc1Q9CWW7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cxxc1Q9CWW7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cxxc1Q9CWW7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cxxc1Q9CWW7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cxxc1Q9CWW7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cxxc1Q9CWW7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cxxc1Q9CWW7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cxxc1Q9CWW7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cxxc1Q9CWW7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cxxc1Q9CWW7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cxxc1Q9CWW7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cxxc1Q9CWW7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cxxc1Q9CWW7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cxxc1Q9CWW7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cxxc1Q9CWW7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cxxc1Q9CWW7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cxxc1Q9CWW7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cxxc1Q9CWW7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cxxc1Q9CWW7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cxxc1Q9CWW7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cxxc1Q9CWW7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cxxc1Q9CWW7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cxxc1Q9CWW7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cxxc1Q9CWW7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cxxc1Q9CWW7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cxxc1Q9CWW7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cxxc1Q9CWW7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cxxc1Q9CWW7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cxxc1Q9CWW7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cxxc1Q9CWW7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cxxc1Q9CWW7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cxxc1Q9CWW7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cxxc1Q9CWW7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cxxc1Q9CWW7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cxxc1Q9CWW7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cxxc1Q9CWW7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cxxc1Q9CWW7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cxxc1Q9CWW7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cxxc1Q9CWW7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cxxc1Q9CWW7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cxxc1Q9CWW7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cxxc1Q9CWW7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cxxc1Q9CWW7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cxxc1Q9CWW7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cxxc1Q9CWW7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cxxc1Q9CWW7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cxxc1Q9CWW7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cxxc1Q9CWW7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cxxc1Q9CWW7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cxxc1Q9CWW7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cxxc1Q9CWW7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cxxc1Q9CWW7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cxxc1Q9CWW7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cxxc1Q9CWW7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cxxc1Q9CWW7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cxxc1Q9CWW7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cxxc1Q9CWW7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cxxc1Q9CWW7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cxxc1Q9CWW7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cxxc1Q9CWW7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cxxc1Q9CWW7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cxxc1Q9CWW7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms