Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Khdc3Q9CWU5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Khdc3Q9CWU5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Khdc3Q9CWU5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Khdc3Q9CWU5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Khdc3Q9CWU5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Khdc3Q9CWU5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Khdc3Q9CWU5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Khdc3Q9CWU5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Khdc3Q9CWU5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Khdc3Q9CWU5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Khdc3Q9CWU5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Khdc3Q9CWU5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Khdc3Q9CWU5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Khdc3Q9CWU5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Khdc3Q9CWU5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Khdc3Q9CWU5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Khdc3Q9CWU5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Khdc3Q9CWU5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Khdc3Q9CWU5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Khdc3Q9CWU5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Khdc3Q9CWU5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Khdc3Q9CWU5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Khdc3Q9CWU5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Khdc3Q9CWU5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Khdc3Q9CWU5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Khdc3Q9CWU5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Khdc3Q9CWU5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Khdc3Q9CWU5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Khdc3Q9CWU5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Khdc3Q9CWU5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Khdc3Q9CWU5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Khdc3Q9CWU5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Khdc3Q9CWU5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Khdc3Q9CWU5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Khdc3Q9CWU5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Khdc3Q9CWU5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Khdc3Q9CWU5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Khdc3Q9CWU5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Khdc3Q9CWU5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Khdc3Q9CWU5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Khdc3Q9CWU5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Khdc3Q9CWU5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Khdc3Q9CWU5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Khdc3Q9CWU5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Khdc3Q9CWU5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Khdc3Q9CWU5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Khdc3Q9CWU5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Khdc3Q9CWU5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Khdc3Q9CWU5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Khdc3Q9CWU5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Khdc3Q9CWU5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Khdc3Q9CWU5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Khdc3Q9CWU5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Khdc3Q9CWU5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Khdc3Q9CWU5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Khdc3Q9CWU5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Khdc3Q9CWU5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Khdc3Q9CWU5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Khdc3Q9CWU5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Khdc3Q9CWU5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Khdc3Q9CWU5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Khdc3Q9CWU5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Khdc3Q9CWU5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Khdc3Q9CWU5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Khdc3Q9CWU5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Khdc3Q9CWU5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Khdc3Q9CWU5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Khdc3Q9CWU5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Khdc3Q9CWU5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Khdc3Q9CWU5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Khdc3Q9CWU5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Khdc3Q9CWU5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Khdc3Q9CWU5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Khdc3Q9CWU5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Khdc3Q9CWU5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Khdc3Q9CWU5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Khdc3Q9CWU5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Khdc3Q9CWU5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Khdc3Q9CWU5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Khdc3Q9CWU5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Khdc3Q9CWU5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Khdc3Q9CWU5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Khdc3Q9CWU5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Khdc3Q9CWU5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Khdc3Q9CWU5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Khdc3Q9CWU5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Khdc3Q9CWU5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Khdc3Q9CWU5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Khdc3Q9CWU5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Khdc3Q9CWU5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Khdc3Q9CWU5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Khdc3Q9CWU5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Khdc3Q9CWU5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Khdc3Q9CWU5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Khdc3Q9CWU5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Khdc3Q9CWU5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Khdc3Q9CWU5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Khdc3Q9CWU5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Khdc3Q9CWU5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms