Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930519P11RikQ9CUJ8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930519P11RikQ9CUJ8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930519P11RikQ9CUJ8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930519P11RikQ9CUJ8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930519P11RikQ9CUJ8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930519P11RikQ9CUJ8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930519P11RikQ9CUJ8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930519P11RikQ9CUJ8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930519P11RikQ9CUJ8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930519P11RikQ9CUJ8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930519P11RikQ9CUJ8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930519P11RikQ9CUJ8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930519P11RikQ9CUJ8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930519P11RikQ9CUJ8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930519P11RikQ9CUJ8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930519P11RikQ9CUJ8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930519P11RikQ9CUJ8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930519P11RikQ9CUJ8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930519P11RikQ9CUJ8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930519P11RikQ9CUJ8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930519P11RikQ9CUJ8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930519P11RikQ9CUJ8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930519P11RikQ9CUJ8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930519P11RikQ9CUJ8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930519P11RikQ9CUJ8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930519P11RikQ9CUJ8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930519P11RikQ9CUJ8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930519P11RikQ9CUJ8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930519P11RikQ9CUJ8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930519P11RikQ9CUJ8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930519P11RikQ9CUJ8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930519P11RikQ9CUJ8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930519P11RikQ9CUJ8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930519P11RikQ9CUJ8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930519P11RikQ9CUJ8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930519P11RikQ9CUJ8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930519P11RikQ9CUJ8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
4930519P11RikQ9CUJ8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930519P11RikQ9CUJ8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930519P11RikQ9CUJ8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930519P11RikQ9CUJ8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
4930519P11RikQ9CUJ8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930519P11RikQ9CUJ8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930519P11RikQ9CUJ8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930519P11RikQ9CUJ8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930519P11RikQ9CUJ8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930519P11RikQ9CUJ8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930519P11RikQ9CUJ8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930519P11RikQ9CUJ8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930519P11RikQ9CUJ8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930519P11RikQ9CUJ8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930519P11RikQ9CUJ8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930519P11RikQ9CUJ8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930519P11RikQ9CUJ8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930519P11RikQ9CUJ8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930519P11RikQ9CUJ8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930519P11RikQ9CUJ8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930519P11RikQ9CUJ8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930519P11RikQ9CUJ8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930519P11RikQ9CUJ8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930519P11RikQ9CUJ8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930519P11RikQ9CUJ8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930519P11RikQ9CUJ8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930519P11RikQ9CUJ8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930519P11RikQ9CUJ8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930519P11RikQ9CUJ8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930519P11RikQ9CUJ8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930519P11RikQ9CUJ8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930519P11RikQ9CUJ8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930519P11RikQ9CUJ8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930519P11RikQ9CUJ8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930519P11RikQ9CUJ8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930519P11RikQ9CUJ8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930519P11RikQ9CUJ8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930519P11RikQ9CUJ8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930519P11RikQ9CUJ8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930519P11RikQ9CUJ8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930519P11RikQ9CUJ8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930519P11RikQ9CUJ8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930519P11RikQ9CUJ8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930519P11RikQ9CUJ8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930519P11RikQ9CUJ8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930519P11RikQ9CUJ8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930519P11RikQ9CUJ8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
4930519P11RikQ9CUJ8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms