Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CRC3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CRC3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CRC3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CRC3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9CRC3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9CRC3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9CRC3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9CRC3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9CRC3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9CRC3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9CRC3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9CRC3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9CRC3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9CRC3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9CRC3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9CRC3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9CRC3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9CRC3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9CRC3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9CRC3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9CRC3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9CRC3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9CRC3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9CRC3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9CRC3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q9CRC3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9CRC3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9CRC3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9CRC3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9CRC3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9CRC3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9CRC3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9CRC3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9CRC3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9CRC3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9CRC3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9CRC3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9CRC3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9CRC3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9CRC3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9CRC3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9CRC3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9CRC3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9CRC3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9CRC3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9CRC3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9CRC3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9CRC3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9CRC3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9CRC3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9CRC3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9CRC3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9CRC3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9CRC3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9CRC3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9CRC3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9CRC3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9CRC3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9CRC3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9CRC3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9CRC3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9CRC3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9CRC3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9CRC3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9CRC3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9CRC3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9CRC3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9CRC3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9CRC3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9CRC3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9CRC3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9CRC3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9CRC3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q9CRC3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q9CRC3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9CRC3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9CRC3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9CRC3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9CRC3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9CRC3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9CRC3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9CRC3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9CRC3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9CRC3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9CRC3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9CRC3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9CRC3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9CRC3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9CRC3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9CRC3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9CRC3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9CRC3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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