Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR02

Tma16, Translation machinery-associated protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tma16Q9CR02 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tma16Q9CR02 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tma16Q9CR02 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tma16Q9CR02 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tma16Q9CR02 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tma16Q9CR02 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tma16Q9CR02 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tma16Q9CR02 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tma16Q9CR02 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tma16Q9CR02 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tma16Q9CR02 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tma16Q9CR02 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tma16Q9CR02 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tma16Q9CR02 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tma16Q9CR02 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tma16Q9CR02 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tma16Q9CR02 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tma16Q9CR02 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tma16Q9CR02 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tma16Q9CR02 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tma16Q9CR02 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tma16Q9CR02 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tma16Q9CR02 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tma16Q9CR02 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tma16Q9CR02 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tma16Q9CR02 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tma16Q9CR02 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tma16Q9CR02 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tma16Q9CR02 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tma16Q9CR02 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tma16Q9CR02 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tma16Q9CR02 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tma16Q9CR02 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tma16Q9CR02 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tma16Q9CR02 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tma16Q9CR02 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tma16Q9CR02 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tma16Q9CR02 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tma16Q9CR02 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tma16Q9CR02 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tma16Q9CR02 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tma16Q9CR02 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tma16Q9CR02 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tma16Q9CR02 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tma16Q9CR02 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tma16Q9CR02 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tma16Q9CR02 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tma16Q9CR02 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tma16Q9CR02 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tma16Q9CR02 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tma16Q9CR02 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tma16Q9CR02 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tma16Q9CR02 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tma16Q9CR02 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tma16Q9CR02 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tma16Q9CR02 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tma16Q9CR02 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tma16Q9CR02 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tma16Q9CR02 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tma16Q9CR02 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tma16Q9CR02 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tma16Q9CR02 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tma16Q9CR02 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tma16Q9CR02 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tma16Q9CR02 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tma16Q9CR02 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tma16Q9CR02 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tma16Q9CR02 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tma16Q9CR02 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tma16Q9CR02 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tma16Q9CR02 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tma16Q9CR02 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tma16Q9CR02 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tma16Q9CR02 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tma16Q9CR02 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tma16Q9CR02 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tma16Q9CR02 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tma16Q9CR02 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tma16Q9CR02 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tma16Q9CR02 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tma16Q9CR02 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tma16Q9CR02 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tma16Q9CR02 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tma16Q9CR02 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tma16Q9CR02 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tma16Q9CR02 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tma16Q9CR02 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tma16Q9CR02 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tma16Q9CR02 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tma16Q9CR02 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tma16Q9CR02 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tma16Q9CR02 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tma16Q9CR02 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tma16Q9CR02 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tma16Q9CR02 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tma16Q9CR02 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tma16Q9CR02 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tma16Q9CR02 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tma16Q9CR02 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tma16Q9CR02 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms