Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccer1Q9CQL2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccer1Q9CQL2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccer1Q9CQL2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccer1Q9CQL2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccer1Q9CQL2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccer1Q9CQL2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccer1Q9CQL2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccer1Q9CQL2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccer1Q9CQL2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccer1Q9CQL2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccer1Q9CQL2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccer1Q9CQL2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccer1Q9CQL2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccer1Q9CQL2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccer1Q9CQL2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccer1Q9CQL2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccer1Q9CQL2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccer1Q9CQL2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccer1Q9CQL2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccer1Q9CQL2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccer1Q9CQL2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccer1Q9CQL2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccer1Q9CQL2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccer1Q9CQL2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccer1Q9CQL2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccer1Q9CQL2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccer1Q9CQL2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccer1Q9CQL2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccer1Q9CQL2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccer1Q9CQL2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccer1Q9CQL2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccer1Q9CQL2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccer1Q9CQL2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccer1Q9CQL2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccer1Q9CQL2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccer1Q9CQL2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccer1Q9CQL2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccer1Q9CQL2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccer1Q9CQL2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccer1Q9CQL2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccer1Q9CQL2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccer1Q9CQL2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccer1Q9CQL2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccer1Q9CQL2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccer1Q9CQL2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccer1Q9CQL2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccer1Q9CQL2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccer1Q9CQL2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccer1Q9CQL2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccer1Q9CQL2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccer1Q9CQL2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccer1Q9CQL2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ccer1Q9CQL2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccer1Q9CQL2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccer1Q9CQL2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccer1Q9CQL2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccer1Q9CQL2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccer1Q9CQL2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccer1Q9CQL2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccer1Q9CQL2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccer1Q9CQL2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccer1Q9CQL2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccer1Q9CQL2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccer1Q9CQL2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccer1Q9CQL2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccer1Q9CQL2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccer1Q9CQL2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccer1Q9CQL2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccer1Q9CQL2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccer1Q9CQL2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccer1Q9CQL2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccer1Q9CQL2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccer1Q9CQL2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccer1Q9CQL2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccer1Q9CQL2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccer1Q9CQL2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccer1Q9CQL2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccer1Q9CQL2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccer1Q9CQL2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccer1Q9CQL2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccer1Q9CQL2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccer1Q9CQL2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccer1Q9CQL2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccer1Q9CQL2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccer1Q9CQL2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccer1Q9CQL2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccer1Q9CQL2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccer1Q9CQL2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccer1Q9CQL2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccer1Q9CQL2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccer1Q9CQL2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccer1Q9CQL2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccer1Q9CQL2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccer1Q9CQL2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccer1Q9CQL2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccer1Q9CQL2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccer1Q9CQL2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccer1Q9CQL2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccer1Q9CQL2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms