Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ndufb9Q9CQJ8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ndufb9Q9CQJ8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ndufb9Q9CQJ8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ndufb9Q9CQJ8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ndufb9Q9CQJ8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ndufb9Q9CQJ8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ndufb9Q9CQJ8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ndufb9Q9CQJ8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ndufb9Q9CQJ8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ndufb9Q9CQJ8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ndufb9Q9CQJ8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ndufb9Q9CQJ8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ndufb9Q9CQJ8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ndufb9Q9CQJ8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ndufb9Q9CQJ8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ndufb9Q9CQJ8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ndufb9Q9CQJ8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ndufb9Q9CQJ8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ndufb9Q9CQJ8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ndufb9Q9CQJ8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ndufb9Q9CQJ8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ndufb9Q9CQJ8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ndufb9Q9CQJ8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ndufb9Q9CQJ8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ndufb9Q9CQJ8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ndufb9Q9CQJ8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ndufb9Q9CQJ8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ndufb9Q9CQJ8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ndufb9Q9CQJ8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ndufb9Q9CQJ8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ndufb9Q9CQJ8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ndufb9Q9CQJ8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ndufb9Q9CQJ8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ndufb9Q9CQJ8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ndufb9Q9CQJ8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ndufb9Q9CQJ8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ndufb9Q9CQJ8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ndufb9Q9CQJ8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ndufb9Q9CQJ8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ndufb9Q9CQJ8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ndufb9Q9CQJ8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ndufb9Q9CQJ8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ndufb9Q9CQJ8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ndufb9Q9CQJ8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ndufb9Q9CQJ8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ndufb9Q9CQJ8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ndufb9Q9CQJ8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ndufb9Q9CQJ8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ndufb9Q9CQJ8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ndufb9Q9CQJ8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ndufb9Q9CQJ8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ndufb9Q9CQJ8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ndufb9Q9CQJ8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ndufb9Q9CQJ8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ndufb9Q9CQJ8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ndufb9Q9CQJ8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ndufb9Q9CQJ8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ndufb9Q9CQJ8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ndufb9Q9CQJ8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ndufb9Q9CQJ8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ndufb9Q9CQJ8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ndufb9Q9CQJ8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ndufb9Q9CQJ8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ndufb9Q9CQJ8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ndufb9Q9CQJ8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ndufb9Q9CQJ8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ndufb9Q9CQJ8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ndufb9Q9CQJ8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ndufb9Q9CQJ8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ndufb9Q9CQJ8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ndufb9Q9CQJ8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ndufb9Q9CQJ8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ndufb9Q9CQJ8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ndufb9Q9CQJ8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ndufb9Q9CQJ8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ndufb9Q9CQJ8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ndufb9Q9CQJ8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ndufb9Q9CQJ8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ndufb9Q9CQJ8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ndufb9Q9CQJ8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ndufb9Q9CQJ8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ndufb9Q9CQJ8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ndufb9Q9CQJ8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ndufb9Q9CQJ8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ndufb9Q9CQJ8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ndufb9Q9CQJ8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms