Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE2

Tmem223, Transmembrane protein 223, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem223Q9CQE2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem223Q9CQE2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem223Q9CQE2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem223Q9CQE2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem223Q9CQE2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem223Q9CQE2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem223Q9CQE2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem223Q9CQE2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem223Q9CQE2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem223Q9CQE2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem223Q9CQE2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem223Q9CQE2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem223Q9CQE2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem223Q9CQE2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem223Q9CQE2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem223Q9CQE2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem223Q9CQE2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem223Q9CQE2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem223Q9CQE2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem223Q9CQE2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem223Q9CQE2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem223Q9CQE2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem223Q9CQE2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem223Q9CQE2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem223Q9CQE2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem223Q9CQE2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem223Q9CQE2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem223Q9CQE2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem223Q9CQE2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem223Q9CQE2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem223Q9CQE2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem223Q9CQE2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem223Q9CQE2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem223Q9CQE2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem223Q9CQE2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem223Q9CQE2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem223Q9CQE2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem223Q9CQE2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem223Q9CQE2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem223Q9CQE2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem223Q9CQE2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem223Q9CQE2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem223Q9CQE2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem223Q9CQE2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem223Q9CQE2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem223Q9CQE2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem223Q9CQE2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem223Q9CQE2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem223Q9CQE2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem223Q9CQE2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem223Q9CQE2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem223Q9CQE2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem223Q9CQE2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem223Q9CQE2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem223Q9CQE2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem223Q9CQE2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem223Q9CQE2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem223Q9CQE2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem223Q9CQE2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem223Q9CQE2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem223Q9CQE2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem223Q9CQE2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem223Q9CQE2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem223Q9CQE2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem223Q9CQE2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem223Q9CQE2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem223Q9CQE2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmem223Q9CQE2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem223Q9CQE2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem223Q9CQE2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem223Q9CQE2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem223Q9CQE2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem223Q9CQE2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem223Q9CQE2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem223Q9CQE2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem223Q9CQE2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem223Q9CQE2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem223Q9CQE2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem223Q9CQE2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem223Q9CQE2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem223Q9CQE2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem223Q9CQE2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem223Q9CQE2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem223Q9CQE2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem223Q9CQE2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem223Q9CQE2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem223Q9CQE2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem223Q9CQE2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem223Q9CQE2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem223Q9CQE2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem223Q9CQE2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem223Q9CQE2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem223Q9CQE2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem223Q9CQE2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem223Q9CQE2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem223Q9CQE2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem223Q9CQE2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem223Q9CQE2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmem223Q9CQE2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem223Q9CQE2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms