Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE0

Rnf138, E3 ubiquitin-protein ligase RNF138, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138Q9CQE0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf138Q9CQE0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf138Q9CQE0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf138Q9CQE0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf138Q9CQE0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf138Q9CQE0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf138Q9CQE0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf138Q9CQE0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf138Q9CQE0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf138Q9CQE0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf138Q9CQE0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf138Q9CQE0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf138Q9CQE0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf138Q9CQE0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf138Q9CQE0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf138Q9CQE0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf138Q9CQE0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf138Q9CQE0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf138Q9CQE0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf138Q9CQE0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf138Q9CQE0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf138Q9CQE0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf138Q9CQE0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf138Q9CQE0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf138Q9CQE0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf138Q9CQE0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf138Q9CQE0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf138Q9CQE0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rnf138Q9CQE0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf138Q9CQE0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf138Q9CQE0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf138Q9CQE0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf138Q9CQE0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf138Q9CQE0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf138Q9CQE0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf138Q9CQE0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf138Q9CQE0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf138Q9CQE0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf138Q9CQE0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf138Q9CQE0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf138Q9CQE0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf138Q9CQE0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf138Q9CQE0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf138Q9CQE0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf138Q9CQE0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf138Q9CQE0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf138Q9CQE0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf138Q9CQE0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf138Q9CQE0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf138Q9CQE0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf138Q9CQE0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf138Q9CQE0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf138Q9CQE0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf138Q9CQE0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf138Q9CQE0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf138Q9CQE0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf138Q9CQE0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf138Q9CQE0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf138Q9CQE0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf138Q9CQE0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf138Q9CQE0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf138Q9CQE0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf138Q9CQE0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf138Q9CQE0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf138Q9CQE0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf138Q9CQE0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf138Q9CQE0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf138Q9CQE0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf138Q9CQE0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf138Q9CQE0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf138Q9CQE0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf138Q9CQE0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf138Q9CQE0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf138Q9CQE0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf138Q9CQE0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf138Q9CQE0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf138Q9CQE0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf138Q9CQE0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf138Q9CQE0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf138Q9CQE0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf138Q9CQE0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf138Q9CQE0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf138Q9CQE0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf138Q9CQE0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf138Q9CQE0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf138Q9CQE0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf138Q9CQE0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf138Q9CQE0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf138Q9CQE0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf138Q9CQE0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rnf138Q9CQE0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf138Q9CQE0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf138Q9CQE0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf138Q9CQE0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf138Q9CQE0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf138Q9CQE0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf138Q9CQE0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf138Q9CQE0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf138Q9CQE0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf138Q9CQE0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms