Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ91

Ndufa3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 84 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa3Q9CQ91 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufa3Q9CQ91 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufa3Q9CQ91 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufa3Q9CQ91 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufa3Q9CQ91 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufa3Q9CQ91 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufa3Q9CQ91 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufa3Q9CQ91 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufa3Q9CQ91 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufa3Q9CQ91 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufa3Q9CQ91 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufa3Q9CQ91 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufa3Q9CQ91 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufa3Q9CQ91 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufa3Q9CQ91 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufa3Q9CQ91 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufa3Q9CQ91 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufa3Q9CQ91 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufa3Q9CQ91 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufa3Q9CQ91 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufa3Q9CQ91 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufa3Q9CQ91 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufa3Q9CQ91 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufa3Q9CQ91 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufa3Q9CQ91 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufa3Q9CQ91 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufa3Q9CQ91 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufa3Q9CQ91 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufa3Q9CQ91 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufa3Q9CQ91 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufa3Q9CQ91 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufa3Q9CQ91 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufa3Q9CQ91 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufa3Q9CQ91 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufa3Q9CQ91 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufa3Q9CQ91 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufa3Q9CQ91 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufa3Q9CQ91 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufa3Q9CQ91 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufa3Q9CQ91 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufa3Q9CQ91 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufa3Q9CQ91 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufa3Q9CQ91 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufa3Q9CQ91 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufa3Q9CQ91 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufa3Q9CQ91 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufa3Q9CQ91 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufa3Q9CQ91 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufa3Q9CQ91 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufa3Q9CQ91 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufa3Q9CQ91 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufa3Q9CQ91 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufa3Q9CQ91 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufa3Q9CQ91 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufa3Q9CQ91 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufa3Q9CQ91 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufa3Q9CQ91 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufa3Q9CQ91 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ndufa3Q9CQ91 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufa3Q9CQ91 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufa3Q9CQ91 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufa3Q9CQ91 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufa3Q9CQ91 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufa3Q9CQ91 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufa3Q9CQ91 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufa3Q9CQ91 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufa3Q9CQ91 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufa3Q9CQ91 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufa3Q9CQ91 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufa3Q9CQ91 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufa3Q9CQ91 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufa3Q9CQ91 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufa3Q9CQ91 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufa3Q9CQ91 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa3Q9CQ91 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa3Q9CQ91 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa3Q9CQ91 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa3Q9CQ91 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa3Q9CQ91 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa3Q9CQ91 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa3Q9CQ91 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa3Q9CQ91 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufa3Q9CQ91 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ndufa3Q9CQ91 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ndufa3Q9CQ91 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufa3Q9CQ91 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufa3Q9CQ91 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufa3Q9CQ91 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufa3Q9CQ91 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufa3Q9CQ91 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufa3Q9CQ91 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufa3Q9CQ91 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufa3Q9CQ91 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufa3Q9CQ91 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufa3Q9CQ91 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufa3Q9CQ91 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufa3Q9CQ91 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufa3Q9CQ91 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufa3Q9CQ91 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufa3Q9CQ91 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms