Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pole4Q9CQ36 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pole4Q9CQ36 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pole4Q9CQ36 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pole4Q9CQ36 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pole4Q9CQ36 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pole4Q9CQ36 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pole4Q9CQ36 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pole4Q9CQ36 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pole4Q9CQ36 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pole4Q9CQ36 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pole4Q9CQ36 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pole4Q9CQ36 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pole4Q9CQ36 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pole4Q9CQ36 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pole4Q9CQ36 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pole4Q9CQ36 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pole4Q9CQ36 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pole4Q9CQ36 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pole4Q9CQ36 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pole4Q9CQ36 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pole4Q9CQ36 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pole4Q9CQ36 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pole4Q9CQ36 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pole4Q9CQ36 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pole4Q9CQ36 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pole4Q9CQ36 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pole4Q9CQ36 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pole4Q9CQ36 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pole4Q9CQ36 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pole4Q9CQ36 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pole4Q9CQ36 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pole4Q9CQ36 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pole4Q9CQ36 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pole4Q9CQ36 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pole4Q9CQ36 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pole4Q9CQ36 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pole4Q9CQ36 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pole4Q9CQ36 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pole4Q9CQ36 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pole4Q9CQ36 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pole4Q9CQ36 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pole4Q9CQ36 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pole4Q9CQ36 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pole4Q9CQ36 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pole4Q9CQ36 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pole4Q9CQ36 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pole4Q9CQ36 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pole4Q9CQ36 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pole4Q9CQ36 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pole4Q9CQ36 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pole4Q9CQ36 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pole4Q9CQ36 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pole4Q9CQ36 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pole4Q9CQ36 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pole4Q9CQ36 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pole4Q9CQ36 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pole4Q9CQ36 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pole4Q9CQ36 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pole4Q9CQ36 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pole4Q9CQ36 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pole4Q9CQ36 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pole4Q9CQ36 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pole4Q9CQ36 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pole4Q9CQ36 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pole4Q9CQ36 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pole4Q9CQ36 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pole4Q9CQ36 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pole4Q9CQ36 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pole4Q9CQ36 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pole4Q9CQ36 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pole4Q9CQ36 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pole4Q9CQ36 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pole4Q9CQ36 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pole4Q9CQ36 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pole4Q9CQ36 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pole4Q9CQ36 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pole4Q9CQ36 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pole4Q9CQ36 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pole4Q9CQ36 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pole4Q9CQ36 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pole4Q9CQ36 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pole4Q9CQ36 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pole4Q9CQ36 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pole4Q9CQ36 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pole4Q9CQ36 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pole4Q9CQ36 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pole4Q9CQ36 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pole4Q9CQ36 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pole4Q9CQ36 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pole4Q9CQ36 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pole4Q9CQ36 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pole4Q9CQ36 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pole4Q9CQ36 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pole4Q9CQ36 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pole4Q9CQ36 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pole4Q9CQ36 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pole4Q9CQ36 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pole4Q9CQ36 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pole4Q9CQ36 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms