Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
StambpQ9CQ26 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
StambpQ9CQ26 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
StambpQ9CQ26 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
StambpQ9CQ26 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
StambpQ9CQ26 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
StambpQ9CQ26 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
StambpQ9CQ26 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
StambpQ9CQ26 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
StambpQ9CQ26 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
StambpQ9CQ26 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
StambpQ9CQ26 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
StambpQ9CQ26 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
StambpQ9CQ26 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
StambpQ9CQ26 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
StambpQ9CQ26 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
StambpQ9CQ26 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
StambpQ9CQ26 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
StambpQ9CQ26 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
StambpQ9CQ26 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
StambpQ9CQ26 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
StambpQ9CQ26 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
StambpQ9CQ26 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
StambpQ9CQ26 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
StambpQ9CQ26 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
StambpQ9CQ26 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
StambpQ9CQ26 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
StambpQ9CQ26 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
StambpQ9CQ26 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
StambpQ9CQ26 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
StambpQ9CQ26 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
StambpQ9CQ26 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
StambpQ9CQ26 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
StambpQ9CQ26 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
StambpQ9CQ26 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
StambpQ9CQ26 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
StambpQ9CQ26 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
StambpQ9CQ26 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
StambpQ9CQ26 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
StambpQ9CQ26 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
StambpQ9CQ26 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
StambpQ9CQ26 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
StambpQ9CQ26 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
StambpQ9CQ26 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
StambpQ9CQ26 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
StambpQ9CQ26 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
StambpQ9CQ26 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
StambpQ9CQ26 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
StambpQ9CQ26 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
StambpQ9CQ26 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
StambpQ9CQ26 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
StambpQ9CQ26 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
StambpQ9CQ26 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
StambpQ9CQ26 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
StambpQ9CQ26 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
StambpQ9CQ26 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
StambpQ9CQ26 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
StambpQ9CQ26 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
StambpQ9CQ26 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
StambpQ9CQ26 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
StambpQ9CQ26 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
StambpQ9CQ26 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
StambpQ9CQ26 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
StambpQ9CQ26 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
StambpQ9CQ26 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
StambpQ9CQ26 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
StambpQ9CQ26 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
StambpQ9CQ26 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
StambpQ9CQ26 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
StambpQ9CQ26 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
StambpQ9CQ26 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
StambpQ9CQ26 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
StambpQ9CQ26 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
StambpQ9CQ26 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
StambpQ9CQ26 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
StambpQ9CQ26 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
StambpQ9CQ26 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
StambpQ9CQ26 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
StambpQ9CQ26 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
StambpQ9CQ26 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
StambpQ9CQ26 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
StambpQ9CQ26 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
StambpQ9CQ26 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
StambpQ9CQ26 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
StambpQ9CQ26 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
StambpQ9CQ26 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
StambpQ9CQ26 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
StambpQ9CQ26 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
StambpQ9CQ26 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
StambpQ9CQ26 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
StambpQ9CQ26 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
StambpQ9CQ26 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
StambpQ9CQ26 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
StambpQ9CQ26 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
StambpQ9CQ26 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
StambpQ9CQ26 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
StambpQ9CQ26 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
StambpQ9CQ26 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
StambpQ9CQ26 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
StambpQ9CQ26 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms