Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms