Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Atg3Q9CPX6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Atg3Q9CPX6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Atg3Q9CPX6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Atg3Q9CPX6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Atg3Q9CPX6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Atg3Q9CPX6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Atg3Q9CPX6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Atg3Q9CPX6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Atg3Q9CPX6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Atg3Q9CPX6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Atg3Q9CPX6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Atg3Q9CPX6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Atg3Q9CPX6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Atg3Q9CPX6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Atg3Q9CPX6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Atg3Q9CPX6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Atg3Q9CPX6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Atg3Q9CPX6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Atg3Q9CPX6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Atg3Q9CPX6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Atg3Q9CPX6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Atg3Q9CPX6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Atg3Q9CPX6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Atg3Q9CPX6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Atg3Q9CPX6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Atg3Q9CPX6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Atg3Q9CPX6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Atg3Q9CPX6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Atg3Q9CPX6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Atg3Q9CPX6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Atg3Q9CPX6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Atg3Q9CPX6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Atg3Q9CPX6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Atg3Q9CPX6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Atg3Q9CPX6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Atg3Q9CPX6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Atg3Q9CPX6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Atg3Q9CPX6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Atg3Q9CPX6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Atg3Q9CPX6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Atg3Q9CPX6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Atg3Q9CPX6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Atg3Q9CPX6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Atg3Q9CPX6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Atg3Q9CPX6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Atg3Q9CPX6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Atg3Q9CPX6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Atg3Q9CPX6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Atg3Q9CPX6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Atg3Q9CPX6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Atg3Q9CPX6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Atg3Q9CPX6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Atg3Q9CPX6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Atg3Q9CPX6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Atg3Q9CPX6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Atg3Q9CPX6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Atg3Q9CPX6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Atg3Q9CPX6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Atg3Q9CPX6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Atg3Q9CPX6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Atg3Q9CPX6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Atg3Q9CPX6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Atg3Q9CPX6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Atg3Q9CPX6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Atg3Q9CPX6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Atg3Q9CPX6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Atg3Q9CPX6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Atg3Q9CPX6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Atg3Q9CPX6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Atg3Q9CPX6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Atg3Q9CPX6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Atg3Q9CPX6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Atg3Q9CPX6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Atg3Q9CPX6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Atg3Q9CPX6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Atg3Q9CPX6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Atg3Q9CPX6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Atg3Q9CPX6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Atg3Q9CPX6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Atg3Q9CPX6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Atg3Q9CPX6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Atg3Q9CPX6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Atg3Q9CPX6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Atg3Q9CPX6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Atg3Q9CPX6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Atg3Q9CPX6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Atg3Q9CPX6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Atg3Q9CPX6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Atg3Q9CPX6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Atg3Q9CPX6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Atg3Q9CPX6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Atg3Q9CPX6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Atg3Q9CPX6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Atg3Q9CPX6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Atg3Q9CPX6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Atg3Q9CPX6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Atg3Q9CPX6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Atg3Q9CPX6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Atg3Q9CPX6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms