Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Bcl11bQ99PV8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Bcl11bQ99PV8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Bcl11bQ99PV8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Bcl11bQ99PV8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Bcl11bQ99PV8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Bcl11bQ99PV8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Bcl11bQ99PV8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Bcl11bQ99PV8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Bcl11bQ99PV8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Bcl11bQ99PV8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Bcl11bQ99PV8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Bcl11bQ99PV8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Bcl11bQ99PV8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Bcl11bQ99PV8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Bcl11bQ99PV8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Bcl11bQ99PV8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Bcl11bQ99PV8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Bcl11bQ99PV8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Bcl11bQ99PV8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Bcl11bQ99PV8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Bcl11bQ99PV8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Bcl11bQ99PV8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Bcl11bQ99PV8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Bcl11bQ99PV8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Bcl11bQ99PV8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Bcl11bQ99PV8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Bcl11bQ99PV8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Bcl11bQ99PV8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Bcl11bQ99PV8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Bcl11bQ99PV8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Bcl11bQ99PV8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Bcl11bQ99PV8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Bcl11bQ99PV8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Bcl11bQ99PV8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Bcl11bQ99PV8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Bcl11bQ99PV8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Bcl11bQ99PV8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Bcl11bQ99PV8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Bcl11bQ99PV8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Bcl11bQ99PV8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Bcl11bQ99PV8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Bcl11bQ99PV8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Bcl11bQ99PV8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Bcl11bQ99PV8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Bcl11bQ99PV8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Bcl11bQ99PV8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Bcl11bQ99PV8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Bcl11bQ99PV8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Bcl11bQ99PV8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Bcl11bQ99PV8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Bcl11bQ99PV8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Bcl11bQ99PV8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Bcl11bQ99PV8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Bcl11bQ99PV8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Bcl11bQ99PV8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Bcl11bQ99PV8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Bcl11bQ99PV8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Bcl11bQ99PV8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Bcl11bQ99PV8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Bcl11bQ99PV8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Bcl11bQ99PV8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Bcl11bQ99PV8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Bcl11bQ99PV8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Bcl11bQ99PV8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Bcl11bQ99PV8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Bcl11bQ99PV8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Bcl11bQ99PV8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Bcl11bQ99PV8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Bcl11bQ99PV8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Bcl11bQ99PV8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Bcl11bQ99PV8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Bcl11bQ99PV8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Bcl11bQ99PV8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Bcl11bQ99PV8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Bcl11bQ99PV8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Bcl11bQ99PV8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Bcl11bQ99PV8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Bcl11bQ99PV8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Bcl11bQ99PV8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Bcl11bQ99PV8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Bcl11bQ99PV8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Bcl11bQ99PV8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Bcl11bQ99PV8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Bcl11bQ99PV8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Bcl11bQ99PV8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Bcl11bQ99PV8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Bcl11bQ99PV8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Bcl11bQ99PV8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Bcl11bQ99PV8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Bcl11bQ99PV8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Bcl11bQ99PV8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Bcl11bQ99PV8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Bcl11bQ99PV8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Bcl11bQ99PV8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Bcl11bQ99PV8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Bcl11bQ99PV8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Bcl11bQ99PV8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Bcl11bQ99PV8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Bcl11bQ99PV8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms