Protein–RNA interactions for Protein: Q99P69

Nuf2, Kinetochore protein Nuf2, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nuf2Q99P69 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nuf2Q99P69 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nuf2Q99P69 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nuf2Q99P69 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nuf2Q99P69 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nuf2Q99P69 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nuf2Q99P69 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nuf2Q99P69 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nuf2Q99P69 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nuf2Q99P69 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nuf2Q99P69 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nuf2Q99P69 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nuf2Q99P69 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nuf2Q99P69 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nuf2Q99P69 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nuf2Q99P69 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nuf2Q99P69 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nuf2Q99P69 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nuf2Q99P69 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nuf2Q99P69 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nuf2Q99P69 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nuf2Q99P69 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nuf2Q99P69 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nuf2Q99P69 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nuf2Q99P69 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nuf2Q99P69 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nuf2Q99P69 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nuf2Q99P69 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nuf2Q99P69 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nuf2Q99P69 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nuf2Q99P69 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nuf2Q99P69 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nuf2Q99P69 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nuf2Q99P69 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nuf2Q99P69 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nuf2Q99P69 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nuf2Q99P69 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Nuf2Q99P69 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nuf2Q99P69 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nuf2Q99P69 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nuf2Q99P69 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nuf2Q99P69 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nuf2Q99P69 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nuf2Q99P69 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nuf2Q99P69 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nuf2Q99P69 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nuf2Q99P69 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nuf2Q99P69 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nuf2Q99P69 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nuf2Q99P69 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nuf2Q99P69 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nuf2Q99P69 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nuf2Q99P69 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nuf2Q99P69 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nuf2Q99P69 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nuf2Q99P69 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nuf2Q99P69 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nuf2Q99P69 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nuf2Q99P69 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nuf2Q99P69 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nuf2Q99P69 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nuf2Q99P69 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nuf2Q99P69 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nuf2Q99P69 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nuf2Q99P69 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nuf2Q99P69 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nuf2Q99P69 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nuf2Q99P69 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nuf2Q99P69 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nuf2Q99P69 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nuf2Q99P69 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nuf2Q99P69 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nuf2Q99P69 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nuf2Q99P69 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nuf2Q99P69 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nuf2Q99P69 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nuf2Q99P69 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nuf2Q99P69 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nuf2Q99P69 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nuf2Q99P69 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nuf2Q99P69 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nuf2Q99P69 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nuf2Q99P69 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nuf2Q99P69 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nuf2Q99P69 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nuf2Q99P69 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nuf2Q99P69 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nuf2Q99P69 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nuf2Q99P69 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nuf2Q99P69 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nuf2Q99P69 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nuf2Q99P69 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nuf2Q99P69 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nuf2Q99P69 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nuf2Q99P69 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nuf2Q99P69 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nuf2Q99P69 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nuf2Q99P69 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nuf2Q99P69 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nuf2Q99P69 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms