Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE9

Pbx4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx4Q99NE9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pbx4Q99NE9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pbx4Q99NE9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pbx4Q99NE9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pbx4Q99NE9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pbx4Q99NE9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pbx4Q99NE9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pbx4Q99NE9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pbx4Q99NE9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pbx4Q99NE9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pbx4Q99NE9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pbx4Q99NE9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pbx4Q99NE9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pbx4Q99NE9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pbx4Q99NE9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pbx4Q99NE9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pbx4Q99NE9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pbx4Q99NE9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pbx4Q99NE9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pbx4Q99NE9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Pbx4Q99NE9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pbx4Q99NE9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pbx4Q99NE9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pbx4Q99NE9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pbx4Q99NE9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Pbx4Q99NE9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pbx4Q99NE9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pbx4Q99NE9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pbx4Q99NE9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pbx4Q99NE9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pbx4Q99NE9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pbx4Q99NE9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pbx4Q99NE9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pbx4Q99NE9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Pbx4Q99NE9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pbx4Q99NE9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pbx4Q99NE9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pbx4Q99NE9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pbx4Q99NE9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pbx4Q99NE9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Pbx4Q99NE9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pbx4Q99NE9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pbx4Q99NE9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pbx4Q99NE9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pbx4Q99NE9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pbx4Q99NE9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pbx4Q99NE9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pbx4Q99NE9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pbx4Q99NE9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pbx4Q99NE9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pbx4Q99NE9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pbx4Q99NE9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Pbx4Q99NE9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pbx4Q99NE9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pbx4Q99NE9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Pbx4Q99NE9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pbx4Q99NE9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pbx4Q99NE9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pbx4Q99NE9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pbx4Q99NE9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pbx4Q99NE9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pbx4Q99NE9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pbx4Q99NE9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pbx4Q99NE9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pbx4Q99NE9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pbx4Q99NE9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pbx4Q99NE9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Pbx4Q99NE9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pbx4Q99NE9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pbx4Q99NE9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pbx4Q99NE9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pbx4Q99NE9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Pbx4Q99NE9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pbx4Q99NE9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pbx4Q99NE9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pbx4Q99NE9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pbx4Q99NE9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pbx4Q99NE9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pbx4Q99NE9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pbx4Q99NE9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pbx4Q99NE9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pbx4Q99NE9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pbx4Q99NE9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pbx4Q99NE9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pbx4Q99NE9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Pbx4Q99NE9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pbx4Q99NE9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pbx4Q99NE9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pbx4Q99NE9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pbx4Q99NE9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Pbx4Q99NE9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pbx4Q99NE9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pbx4Q99NE9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pbx4Q99NE9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pbx4Q99NE9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pbx4Q99NE9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pbx4Q99NE9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pbx4Q99NE9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pbx4Q99NE9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pbx4Q99NE9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms